More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1511 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7706  coproporphyrinogen dehydrogenase  75.58 
 
 
479 aa  787    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1511  Coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  1013    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  25.19 
 
 
388 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.89 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0299  putative coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 
490 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  24.93 
 
 
379 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  32.66 
 
 
435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 
393 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  24.94 
 
 
379 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  24.02 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.82 
 
 
448 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  24.79 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  23.8 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  23.8 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  24.56 
 
 
378 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  23.8 
 
 
379 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  24.56 
 
 
378 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  23.54 
 
 
379 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  23.54 
 
 
378 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.49 
 
 
391 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  23.08 
 
 
377 aa  107  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2239  coproporphyrinogen III oxidase  30.77 
 
 
409 aa  107  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.51 
 
 
393 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.12 
 
 
578 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  31.19 
 
 
378 aa  106  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  32 
 
 
414 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  29.52 
 
 
376 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  32 
 
 
414 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  22.83 
 
 
377 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  24.66 
 
 
379 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  29.15 
 
 
382 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.5 
 
 
360 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.73 
 
 
404 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2108  coproporphyrinogen III oxidase  28.7 
 
 
409 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  31 
 
 
465 aa  104  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.99 
 
 
418 aa  103  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0697  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.38 
 
 
410 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  30.73 
 
 
384 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.68 
 
 
465 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.68 
 
 
465 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3838  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.32 
 
 
407 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584028  hitchhiker  0.00877773 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0479  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.5 
 
 
385 aa  102  2e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  30.73 
 
 
384 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0475  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  31.5 
 
 
376 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  29.85 
 
 
386 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5773  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.15 
 
 
374 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0890  coproporphyrinogen III oxidase  30.05 
 
 
376 aa  100  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112069  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  30.2 
 
 
396 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.34 
 
 
406 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.06 
 
 
406 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.91 
 
 
403 aa  100  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.21 
 
 
385 aa  100  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  29.35 
 
 
379 aa  100  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.07 
 
 
403 aa  99.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  24.15 
 
 
385 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.23 
 
 
457 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.5 
 
 
381 aa  99.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  23.57 
 
 
374 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.19 
 
 
375 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  32.45 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.43 
 
 
403 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1228  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32 
 
 
380 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1626  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.76 
 
 
387 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.981357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3577  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.47 
 
 
381 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1360  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.53 
 
 
371 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.716239  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3508  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.67 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.230764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1177  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.44 
 
 
372 aa  97.8  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2314  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.9 
 
 
408 aa  97.8  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  20.65 
 
 
378 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  23.84 
 
 
431 aa  97.1  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1655  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30 
 
 
418 aa  97.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  28.57 
 
 
401 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.03 
 
 
380 aa  97.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0667  coproporphyrinogen III oxidase  28.92 
 
 
349 aa  96.7  9e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1263  coproporphyrinogen III oxidase  29.91 
 
 
411 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0206083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2215  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.73 
 
 
412 aa  96.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.892548  normal  0.0148235 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1224  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.58 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380612  normal  0.0249495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1654  coproporphyrinogen III oxidase  28.51 
 
 
350 aa  96.3  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.58488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  30.05 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1168  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.7 
 
 
441 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000790244  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  28.25 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  22.42 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.24 
 
 
395 aa  95.9  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1170  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.89 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  29.85 
 
 
400 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0691  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.38 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  22.42 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  27.67 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1325  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  23.63 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28.96 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2449  coproporphyrinogen III oxidase  26.87 
 
 
514 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.06 
 
 
377 aa  94.7  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  28.96 
 
 
378 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  28.96 
 
 
378 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2843  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.5 
 
 
374 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225724  normal  0.624237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  29.53 
 
 
458 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  28.96 
 
 
378 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  28.65 
 
 
465 aa  94.4  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.08 
 
 
458 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.84 
 
 
423 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>