More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7706 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7706  coproporphyrinogen dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  1004    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1511  Coproporphyrinogen dehydrogenase  75.58 
 
 
481 aa  787    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.11 
 
 
388 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.865362  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0582  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  26.75 
 
 
388 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
465 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.49 
 
 
465 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0299  putative coproporphyrinogen III oxidase  25.57 
 
 
490 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587871  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0545  Coproporphyrinogen dehydrogenase  27.56 
 
 
404 aa  117  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.693751  normal  0.412237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4436  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 
379 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4216  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4542  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 
378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.3385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  25.06 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3018  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.75 
 
 
393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0800  coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 
379 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000109269  hitchhiker  5.6543700000000005e-18 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3559  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.56 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4054  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 
379 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.749761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4168  coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 
379 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  25.59 
 
 
476 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4064  coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 
379 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659192  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3043  coproporphyrinogen III oxidase  25.35 
 
 
378 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000458873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4450  coproporphyrinogen III oxidase  24.08 
 
 
378 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000131876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4398  coproporphyrinogen III oxidase  24.08 
 
 
378 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.601746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4339  coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 
378 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26628e-29 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0144  Coproporphyrinogen dehydrogenase  25.42 
 
 
465 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  24.76 
 
 
460 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1216  coproporphyrinogen III oxidase  26.46 
 
 
378 aa  106  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4462  coproporphyrinogen III oxidase  30.15 
 
 
435 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5458  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.09 
 
 
406 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  25.7 
 
 
458 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  24.82 
 
 
462 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  25.23 
 
 
458 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0455  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.14 
 
 
391 aa  104  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3875  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.2 
 
 
406 aa  103  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.78 
 
 
462 aa  103  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1151  coproporphyrinogen III oxidase  24.11 
 
 
374 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0488  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  21.82 
 
 
374 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  25.12 
 
 
458 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 
487 aa  103  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_002620  TC0322  coproporphyrinogen III oxidase  22.68 
 
 
376 aa  101  2e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  24.11 
 
 
465 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2440  coproporphyrinogen III oxidase  28.64 
 
 
382 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000264436  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.75 
 
 
478 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1249  coproporphyrinogen III oxidase  24.56 
 
 
379 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0997  coproporphyrinogen III oxidase  27.16 
 
 
344 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  24.45 
 
 
481 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1109  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.08 
 
 
377 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.298913  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2382  coproporphyrinogen III oxidase  30.2 
 
 
396 aa  100  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0342073 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1168  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.5 
 
 
441 aa  100  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000790244  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0876  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  26.05 
 
 
457 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0030  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  25.43 
 
 
385 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.949331  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 
460 aa  100  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2293  coproporphyrinogen III oxidase  21.46 
 
 
377 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  24.57 
 
 
460 aa  100  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1655  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.48 
 
 
418 aa  100  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1980  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.32 
 
 
380 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000136099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  22.68 
 
 
510 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2374  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  30.05 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6524  Coproporphyrinogen dehydrogenase  28.94 
 
 
431 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0285  coproporphyrinogen III oxidase  31.79 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13360  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  28.64 
 
 
418 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186133  normal  0.0883125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3855  coproporphyrinogen III oxidase  22.63 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33965  normal  0.277651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3306  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.21 
 
 
423 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661128  normal  0.0726751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  25.36 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1010  coproporphyrinogen III oxidase  23.12 
 
 
379 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2285  Coproporphyrinogen dehydrogenase  31.68 
 
 
403 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  23.66 
 
 
463 aa  98.2  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4306  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.65 
 
 
375 aa  98.2  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0329595  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0776  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  32.84 
 
 
378 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00749552  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1675  coproporphyrinogen III oxidase  23.47 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.370593  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1641  coproporphyrinogen III oxidase  23.47 
 
 
374 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.905653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.3 
 
 
458 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  24.64 
 
 
473 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1148  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  31.5 
 
 
403 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.61254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1304  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  28 
 
 
381 aa  97.8  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1579  coproporphyrinogen III oxidase  26.02 
 
 
474 aa  97.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00577188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0536  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.51 
 
 
578 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3320  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  24.37 
 
 
357 aa  97.4  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00918826  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  23.72 
 
 
483 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  23.72 
 
 
483 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2082  coproporphyrinogen III oxidase  23.53 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  23.72 
 
 
481 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1224  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  32.5 
 
 
441 aa  96.7  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380612  normal  0.0249495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  22.56 
 
 
375 aa  96.7  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  22.56 
 
 
375 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3255  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.33 
 
 
403 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00582345  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2449  coproporphyrinogen III oxidase  29.22 
 
 
514 aa  95.9  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01054  coproporphyrinogen III oxidase  26.07 
 
 
458 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.299097  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2008  coproporphyrinogen III oxidase  21.22 
 
 
377 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2601  coproporphyrinogen III oxidase  28.02 
 
 
414 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  25.29 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1108  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.67 
 
 
360 aa  95.9  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2500  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  20.99 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000623828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2785  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.419951  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  23.72 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  23.72 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3505  coproporphyrinogen III oxidase  28.02 
 
 
414 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.699164  normal  0.0919169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  24.26 
 
 
465 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  25.48 
 
 
463 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  23.47 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>