More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1168 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1224  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  84.58 
 
 
441 aa  788    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000380612  normal  0.0249495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1168  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
441 aa  918    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000790244  hitchhiker  0.000600713 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1655  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  61.66 
 
 
418 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0528  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.06 
 
 
382 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2963  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  46.6 
 
 
387 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000535992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5327  coproporphyrinogen III oxidase  46.32 
 
 
401 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4974  coproporphyrinogen III oxidase  46.88 
 
 
391 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5052  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  48.06 
 
 
404 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3651  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  48.07 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1468  oxygen-independent coproporphyrinogen-III oxidase  44.66 
 
 
375 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0471  coproporphyrinogen III oxidase  47.33 
 
 
404 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0710  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 
375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.963013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5151  coproporphyrinogen III oxidase  46.7 
 
 
391 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.294445  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4159  coproporphyrinogen III oxidase  47.22 
 
 
386 aa  350  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5101  coproporphyrinogen III oxidase  46.88 
 
 
391 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608313  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05040  coproporphyrinogen III oxidase  45.91 
 
 
384 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0485  coproporphyrinogen III oxidase  45.67 
 
 
384 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1121  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.19 
 
 
378 aa  345  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.002803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2472  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.82 
 
 
400 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.8 
 
 
380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.482476  normal  0.758269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1131  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
379 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00230562  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1258  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.52 
 
 
385 aa  343  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0161407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0364  coproporphyrinogen III oxidase  46.63 
 
 
395 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250524  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1188  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.52 
 
 
385 aa  342  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03000  coproporphyrinogen III oxidase  45.78 
 
 
373 aa  340  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1187  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.29 
 
 
385 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.454386  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3031  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.9 
 
 
388 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.472525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2687  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.76 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000667437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1332  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.9 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000575717  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2866  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.71 
 
 
379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00010545  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3046  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.34 
 
 
388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000324324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3189  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
388 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000939892  normal  0.198948 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2276  hypothetical protein  43.58 
 
 
375 aa  336  5.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2693  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.34 
 
 
387 aa  335  7e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2303  hypothetical protein  43.83 
 
 
375 aa  335  7.999999999999999e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3308  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  46.75 
 
 
390 aa  335  7.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3612  coproporphyrinogen III oxidase  45.63 
 
 
379 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3387  coproporphyrinogen III oxidase  45.39 
 
 
378 aa  335  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4258  coproporphyrinogen III oxidase  45.39 
 
 
378 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0740  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.39 
 
 
378 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3359  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  43.81 
 
 
385 aa  333  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02372  coproporphyrinogen III oxidase  43.1 
 
 
385 aa  332  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0759  coproporphyrinogen III oxidase  45.3 
 
 
378 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3115  coproporphyrinogen III oxidase  45.3 
 
 
378 aa  332  6e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3097  coproporphyrinogen III oxidase  44.66 
 
 
378 aa  332  7.000000000000001e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4035  coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 
379 aa  331  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.023291 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1326  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
378 aa  331  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3351  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 
378 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.315269 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0143  coproporphyrinogen III oxidase  45.28 
 
 
376 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1226  coproporphyrinogen dehydrogenase  44.1 
 
 
378 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000226864  normal  0.222132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0825  coproporphyrinogen III oxidase  45.28 
 
 
376 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.330416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0826  coproporphyrinogen III oxidase  45.28 
 
 
376 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0770  coproporphyrinogen III oxidase  44.17 
 
 
378 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.261122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02785  coproporphyrinogen III oxidase  44.9 
 
 
378 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.179359  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02748  hypothetical protein  44.9 
 
 
378 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0755  coproporphyrinogen III oxidase  44.66 
 
 
379 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3447  coproporphyrinogen III oxidase  43.96 
 
 
378 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.286445 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3288  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.58 
 
 
396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3299  coproporphyrinogen III oxidase  45.06 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3343  coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 
378 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3278  coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.026335 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3668  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.02 
 
 
388 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.231493  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3267  coproporphyrinogen III oxidase  43.93 
 
 
378 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3361  coproporphyrinogen III oxidase  44.42 
 
 
380 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00679793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0537  coproporphyrinogen III oxidase  42.37 
 
 
386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0906426  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0117  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
382 aa  326  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3455  coproporphyrinogen III oxidase  44.94 
 
 
380 aa  325  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.766268  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3079  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  43.69 
 
 
380 aa  323  4e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.862444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2483  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  44.47 
 
 
379 aa  322  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.274904  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3273  coproporphyrinogen III oxidase  41.45 
 
 
408 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0789  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 
393 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.284669  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0760  coproporphyrinogen III oxidase  42.55 
 
 
383 aa  319  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2444  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.39 
 
 
385 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3853  coproporphyrinogen III oxidase  43.45 
 
 
399 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.800608  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0847  coproporphyrinogen III oxidase  42.55 
 
 
383 aa  318  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0850  coproporphyrinogen III oxidase  43.48 
 
 
419 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2479  coproporphyrinogen III oxidase  42.27 
 
 
413 aa  316  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2322  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 
388 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0040  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  43.93 
 
 
384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0124  coproporphyrinogen III oxidase  42.38 
 
 
392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4335  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.13 
 
 
389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1082  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.72 
 
 
392 aa  312  5.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2282  coproporphyrinogen III oxidase  42.23 
 
 
422 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.485067  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0007  coproporphyrinogen III oxidase  42.49 
 
 
391 aa  312  9e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.712639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2100  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2644  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1968  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.137157  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0811  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3053  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3019  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.18574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2953  coproporphyrinogen III oxidase  41.75 
 
 
405 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.640184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03584  coproporphyrinogen III oxidase  40.71 
 
 
390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002450  coproporphyrinogen III oxidase, oxygen-independent  40.48 
 
 
392 aa  307  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1582  coproporphyrinogen III oxidase  41.26 
 
 
405 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229924  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4103  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 
404 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.274585  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0955  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.337282  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0516  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0995  coproporphyrinogen III oxidase  39.86 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.369674  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0867  coproporphyrinogen III oxidase  40.33 
 
 
404 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2405  coproporphyrinogen III oxidase  40.1 
 
 
404 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>