82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2709 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 351 aa  703    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  67.91 
 
 		 351 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  67.62 
 
 		 350 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.34 
 
 		 351 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  66.1 
 
 		 351 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  62.57 
 
 		 350 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  42.74 
 
 		 371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  49.38 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  41.42 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.09 
 
 		 359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  38.78 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  25.88 
 
 		 408 aa  96.7  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  24.09 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  24.29 
 
 		 404 aa  86.3  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25 
 
 		 401 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  30.86 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  25.41 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  23.82 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  23.82 
 
 		 372 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  25.56 
 
 		 372 aa  53.1  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  34.13 
 
 		 376 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  31.07 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  28.15 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  23.63 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0622  alanine dehydrogenase  25.9 
 
 		 373 aa  49.7  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0104  alanine dehydrogenase  25.22 
 
 		 374 aa  49.3  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  26.99 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2488  L-alanine dehydrogenase  24.18 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  26.05 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  31.13 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  24.64 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  25.72 
 
 		 377 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  24.22 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1771  alanine dehydrogenase  26.16 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.970894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2145  L-alanine dehydrogenase  31.25 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.147893 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2150  L-alanine dehydrogenase  25.64 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2087  L-alanine dehydrogenase  25.64 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2170  alanine dehydrogenase  25 
 
 		 369 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.443019  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2104  L-alanine dehydrogenase  25.64 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.364817  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4054  alanine dehydrogenase  23.64 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  36.71 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  23.68 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  24.43 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  35.96 
 
 		 370 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  33.85 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21050  L-alanine dehydrogenase  23.34 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.809323  normal  0.413541 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0666  alanine dehydrogenase  24.51 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  21.28 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1520  alanine dehydrogenase  25.93 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0484059  hitchhiker  0.000320344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  22.48 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  28.79 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  30.33 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  49.06 
 
 		 1060 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1743  alanine dehydrogenase  24.31 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  29.17 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03060  L-alanine dehydrogenase  33.33 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  21.89 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0649  alanine dehydrogenase  22.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000197457 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0592  alanine dehydrogenase  22.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0039  alanine dehydrogenase  32.98 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0659  alanine dehydrogenase  22.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0561  alanine dehydrogenase  22.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1536  alanine dehydrogenase  32.98 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390556  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0543  alanine dehydrogenase  28.79 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4707  alanine dehydrogenase  22.77 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.394656 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0505  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  22.83 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0484986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0825  alanine dehydrogenase  24.21 
 
 		 373 aa  43.5  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.110091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0720  alanine dehydrogenase  22.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1607  alanine dehydrogenase  24.32 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1449  alanine dehydrogenase  32.98 
 
 		 371 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.283276  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0509  alanine dehydrogenase  22.19 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.153171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0503  alanine dehydrogenase (L-alanine dehydrogenase) (NAD-linked alanine dehydrogenase)  22.83 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  24.12 
 
 		 372 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5878  L-alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0421773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1495  alanine dehydrogenase  38.57 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000156892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1168  L-alanine dehydrogenase  29.17 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  23.51 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0504  alanine dehydrogenase  22.1 
 
 		 377 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5016  alanine dehydrogenase/PNT  42.11 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  22.84 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1570  alanine dehydrogenase  32.61 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.59479  normal  0.391065 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02114  Alanine dehydrogenase A  29.75 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000532758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>