21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2942 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  89.05 
 
 		 351 aa  635    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  89.05 
 
 		 351 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  100 
 
 		 351 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  70.77 
 
 		 350 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  66.1 
 
 		 351 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  62.46 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  46.05 
 
 		 371 aa  301  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  43.36 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.95 
 
 		 359 aa  252  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  47.98 
 
 		 345 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  42.02 
 
 		 395 aa  236  6e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  25.2 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.02 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  24.54 
 
 		 401 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  22.22 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  24.04 
 
 		 934 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  33.33 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  25.93 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  42.86 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  32.54 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  23.91 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>