33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1086 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  100 
 
 		 351 aa  702    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  99.15 
 
 		 351 aa  696    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  89.05 
 
 		 351 aa  617  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  70.98 
 
 		 350 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.91 
 
 		 351 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  62.14 
 
 		 350 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  45.6 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.11 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  43.56 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  46.56 
 
 		 345 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  41.18 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  24.94 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  22.11 
 
 		 400 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  25.06 
 
 		 401 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  23.68 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  27.3 
 
 		 934 aa  60.1  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  34.29 
 
 		 386 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  22.4 
 
 		 371 aa  46.6  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1058  L-alanine dehydrogenase  29.8 
 
 		 371 aa  46.2  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0315596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0473  L-alanine dehydrogenase  34.13 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  31.48 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  31.48 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  32.54 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  31.48 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  23.73 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14670  L-alanine dehydrogenase  27.12 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  27.48 
 
 		 355 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  31.5 
 
 		 392 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0922  alanine dehydrogenase  32.85 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  23.3 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  23.3 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1770  alanine dehydrogenase  26.11 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000379801  normal  0.0234483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05750  alanine dehydrogenase  33.88 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.747804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>