45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86170 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  100 
 
 		 371 aa  762    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  61.08 
 
 		 375 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  61.17 
 
 		 395 aa  393  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  47.09 
 
 		 350 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  45.6 
 
 		 351 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  45.6 
 
 		 351 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  45.78 
 
 		 351 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  42.74 
 
 		 351 aa  283  4.0000000000000003e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  42.15 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  38.86 
 
 		 359 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  40.06 
 
 		 345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.69 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.82 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  24.87 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  23.02 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  26.52 
 
 		 934 aa  56.2  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  39.74 
 
 		 373 aa  50.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1288  L-alanine dehydrogenase  24.01 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.109562  normal  0.0699401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  30.33 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  34.78 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  30.84 
 
 		 355 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10200  NAD/NADP transhydrogenase alpha subunit  40.68 
 
 		 368 aa  46.2  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.787297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1155  alanine dehydrogenase  29.25 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0320425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0064  alanine dehydrogenase  31.87 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0984  alanine dehydrogenase  39.71 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0509355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  31.71 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0191  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  40.35 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.553689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2017  alanine dehydrogenase  41.82 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.02834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1722  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  47.83 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2448  alanine dehydrogenase  34.52 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  38.67 
 
 		 377 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2013  alanine dehydrogenase  29.9 
 
 		 371 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000175382  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23552  predicted protein  42.37 
 
 		 1060 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1049  alanine dehydrogenase  31.58 
 
 		 374 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2450  alanine dehydrogenase  32.22 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.188276  normal  0.405567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2154  alanine dehydrogenase  36.11 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2217  alanine dehydrogenase  28.87 
 
 		 371 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2189  alanine dehydrogenase  22.08 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000553576  normal  0.0277936 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1528  alanine dehydrogenase  36.14 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1499  alanine dehydrogenase  36.14 
 
 		 372 aa  42.7  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0909  pyridine nucleotide transhydrogenase, alpha subunit  48.89 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3299  alanine dehydrogenase  37.33 
 
 		 377 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  37.66 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3222  L-alanine dehydrogenase  34.29 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0766245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0416  alanine dehydrogenase  30.53 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.533057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>