41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4787 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  100 
 
 		 400 aa  822    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  56.64 
 
 		 404 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  41.9 
 
 		 408 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  36.78 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  26.3 
 
 		 934 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  23.98 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  24.09 
 
 		 351 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  23.61 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  22.11 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  22.11 
 
 		 351 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  23.18 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  23.82 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  22.66 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  24.38 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  23.88 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  25.56 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0346  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  22.96 
 
 		 357 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1099  L-alanine dehydrogenase  22.5 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.305636  hitchhiker  0.000729988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5016  alanine dehydrogenase  23.42 
 
 		 372 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0921868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3174  L-alanine dehydrogenase  23.38 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  23.56 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0203  alanine dehydrogenase  21.88 
 
 		 370 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193787  normal  0.15922 
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  22.19 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1765  alanine dehydrogenase  24.3 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1800  alanine dehydrogenase  24.3 
 
 		 372 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3605  alanine dehydrogenase  22.39 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3005  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  28 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2022  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  28.57 
 
 		 364 aa  46.6  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1995  L-alanine dehydrogenase  23.28 
 
 		 371 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0903  NAD(P) transhydrogenase, alpha subunit  32.88 
 
 		 518 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0644  L-alanine dehydrogenase  22.1 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0163918  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3482  alanine dehydrogenase  22.45 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0213091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1635  alanine dehydrogenase  21.02 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.348616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4741  alanine dehydrogenase  24.51 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1609  alanine dehydrogenase  21.02 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0563  alanine dehydrogenase  30.71 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2902  alanine dehydrogenase  23.56 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3004  alanine dehydrogenase  26.67 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.914674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4453  alanine dehydrogenase  24.79 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0857625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0506  alanine dehydrogenase  22.85 
 
 		 377 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2005  alanine dehydrogenase and pyridine nucleotide transhydrogenase  25.18 
 
 		 355 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>