25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0107 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  100 
 
 		 350 aa  710    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  70.98 
 
 		 351 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  70.98 
 
 		 351 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  70.77 
 
 		 351 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  67.62 
 
 		 351 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  57.76 
 
 		 350 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  47.09 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  44.54 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  45.38 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  47.14 
 
 		 345 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  43.1 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.61 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  24.26 
 
 		 408 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  22.92 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  23.36 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  25.49 
 
 		 934 aa  70.1  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2292  alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 365 aa  50.1  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  24.63 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  30.56 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0761  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  46.15 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  30.56 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  28.7 
 
 		 390 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  24.93 
 
 		 371 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  30 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>