46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3541 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3541  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  100 
 
 		 345 aa  673    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1048  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  59.16 
 
 		 359 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0283981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2709  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  48.3 
 
 		 351 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0107  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  47.71 
 
 		 350 aa  280  3e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2942  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-lysine-forming)  47.73 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1086  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  46.31 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4015  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming)  44.57 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.874849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2749  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  46.02 
 
 		 351 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86170  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (Lysine--2-oxoglutarate reductase) (SDH)  40.38 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02873  Saccharopine dehydrogenase [NAD+, L-lysine-forming] (SDH)(EC 1.5.1.7)(Lysine--2-oxoglutarate reductase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q870G1]  39.73 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.799324  normal  0.756333 
 
 
-
 
NC_006686  CND06290  saccharopine dehydrogenase (NAD+, L-lysine-forming), putative  37.04 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.699378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3369  hypothetical protein  22.74 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0502916  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4787  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  23.56 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3374  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  22.99 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200237  normal  0.0897207 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02370  saccharopine dehydrogenase (NADP+, L-glutamate-forming), putative  29.09 
 
 		 934 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840978  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00210  hypothetical saccharopine dehydrogenase  23.63 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3880  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  29 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0784  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  33.14 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176883  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0788  alanine dehydrogenase/PNT-like protein  33.14 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0803  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  33.14 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509413  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0822  alanine dehydrogenase  25.69 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.709879 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1670  L-alanine dehydrogenase  23.01 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.379169  hitchhiker  0.00928718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3512  alanine dehydrogenase  25.95 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2698  alanine dehydrogenase  24.12 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1334  alanine dehydrogenase  33.07 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0961  L-alanine dehydrogenase  24.07 
 
 		 373 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2442  alanine dehydrogenase  24.51 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.4786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0465  alanine dehydrogenase  24.18 
 
 		 406 aa  47  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1767  alanine dehydrogenase  26.72 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3380  alanine dehydrogenase  24.44 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.748696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1272  alanine dehydrogenase  23.26 
 
 		 371 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2966  L-alanine dehydrogenase  25.74 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1445  L-alanine dehydrogenase  27.6 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4430  alanine dehydrogenase  24.22 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.421727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1044  NAD(P) transhydrogenase subunit alpha  35.2 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4085  alanine dehydrogenase  25.14 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3668  alanine dehydrogenase/PNT domain protein  26.74 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1847  alanine dehydrogenase  26.15 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1368  alanine dehydrogenase  24.86 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0765  alanine dehydrogenase  24.52 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2378  alanine dehydrogenase  23.68 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12793  secreted L-alanine dehydrogenase ald (40 kDa antigen)  23.71 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74924 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2109  L-alanine dehydrogenase  26.15 
 
 		 370 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3628  L-alanine dehydrogenase  26.4 
 
 		 374 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.243923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2462  alanine dehydrogenase  23.91 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000220592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3071  alanine dehydrogenase  25.07 
 
 		 370 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>