More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0267 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0267  ABC-type transport system, permease component  100 
 
 		 406 aa  808    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1335  ABC transporter, permease protein  54.81 
 
 		 411 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0113207  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  54.11 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0798  hypothetical protein  54.25 
 
 		 406 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  34.46 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  33.66 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 409 aa  209  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  33.09 
 
 		 409 aa  205  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  33.42 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  32.68 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  30.42 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  32.59 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  31.19 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  31.19 
 
 		 409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  31.03 
 
 		 408 aa  193  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.99 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  28.82 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.05 
 
 		 400 aa  189  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  30.6 
 
 		 405 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 406 aa  189  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.26 
 
 		 409 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.75 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.54 
 
 		 658 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.5 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  30.94 
 
 		 403 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  31.63 
 
 		 405 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  28.12 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  29.76 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  31.03 
 
 		 657 aa  183  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.29 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  32.27 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  28.82 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  31.09 
 
 		 652 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  30.6 
 
 		 651 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.78 
 
 		 653 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  27.5 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  29.66 
 
 		 409 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.81 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.15 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.86 
 
 		 656 aa  177  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  32.1 
 
 		 671 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  30.47 
 
 		 653 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 		 403 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  27.71 
 
 		 715 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  29.34 
 
 		 391 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.43 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 406 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  29.6 
 
 		 402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  30.51 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  30.9 
 
 		 411 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30 
 
 		 411 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.87 
 
 		 657 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 		 403 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.43 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  28.71 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.86 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  31.45 
 
 		 682 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.9 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  31.45 
 
 		 682 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  27.83 
 
 		 647 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  29.27 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  31.65 
 
 		 410 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  26.96 
 
 		 423 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  31.2 
 
 		 667 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  31.01 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  28.93 
 
 		 647 aa  166  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  31.2 
 
 		 667 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 		 412 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  30.52 
 
 		 416 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.2 
 
 		 656 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  27.56 
 
 		 657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  28.4 
 
 		 670 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0319  hypothetical protein  32.35 
 
 		 405 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.331177  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.48 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  29.95 
 
 		 661 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  30.32 
 
 		 654 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  29.43 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  29.43 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  32.59 
 
 		 668 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  32.59 
 
 		 668 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 649 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.71 
 
 		 656 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  27.36 
 
 		 394 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  28.14 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  29.88 
 
 		 653 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>