165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02861 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02861  hydrolase, alpha/beta fold family protein  100 
 
 
371 aa  748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  64.69 
 
 
372 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1667  hypothetical protein  26.85 
 
 
311 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000328892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  32.56 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.67 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  27.98 
 
 
319 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1375  alpha/beta fold family hydrolase  21.02 
 
 
314 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000598397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0300  alpha/beta hydrolase  26.04 
 
 
319 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4715  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  28.17 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0915  Lysophospholipase-like protein  34.44 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.452127  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  25.5 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  27.8 
 
 
272 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1158  hypothetical protein  36.45 
 
 
337 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000697684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  25.91 
 
 
300 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0993  hypothetical protein  33.96 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.261261  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  34.23 
 
 
283 aa  56.6  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  34.07 
 
 
294 aa  55.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 
295 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  29.96 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27.13 
 
 
390 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1668  alpha/beta fold family hydrolase  25.26 
 
 
317 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0139798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0251  putative alpha/beta hydrolase  25.52 
 
 
319 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  25.89 
 
 
319 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4068  hypothetical protein  29.34 
 
 
310 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.86962  normal  0.017048 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
336 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1447  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  33.61 
 
 
285 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  35.14 
 
 
295 aa  53.1  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  27.63 
 
 
273 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  28.4 
 
 
497 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  36.84 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.35 
 
 
315 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6946  hypothetical protein  29.32 
 
 
262 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  34.55 
 
 
270 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
284 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  35.79 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
423 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6102  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
270 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
256 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4239  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0491  alpha/beta fold family hydrolase  27.19 
 
 
309 aa  50.4  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000476721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4015  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3848  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3862  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  29.17 
 
 
270 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4328  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1021  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  23.5 
 
 
313 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
306 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4130  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
270 aa  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.3 
 
 
314 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4277  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
333 aa  49.7  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197929  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
270 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
270 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
302 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4175  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0208  alpha/beta fold family hydrolase  18.45 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0226  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3438  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase-like protein  24.76 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4216  hypothetical protein  33.33 
 
 
308 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  34.74 
 
 
300 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1527  alpha/beta fold family hydrolase  31 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3470  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.304783  normal  0.0123461 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4527  hypothetical protein  25.4 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
287 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3855  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
270 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.09 
 
 
302 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  30.63 
 
 
280 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  26.85 
 
 
281 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3907  alpha/beta hydrolase fold  28.5 
 
 
269 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000000804884  normal  0.943348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  25.38 
 
 
322 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0109  hypothetical protein  26.36 
 
 
325 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.128866  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4021  alpha/beta hydrolase fold protein  28.5 
 
 
269 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.000000197083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2170  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  35.19 
 
 
319 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.264266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  30.89 
 
 
300 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0626  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
284 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
272 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3938  hypothetical protein  32.14 
 
 
307 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1123  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.07 
 
 
678 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.361162  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5113  predicted protein  25 
 
 
276 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00868611  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
305 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
327 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3723  alpha/beta hydrolase fold  43.02 
 
 
281 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0906881  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0347  peptidase S15  32.86 
 
 
686 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
273 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  27.6 
 
 
314 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  30.85 
 
 
668 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4832  peptidase S15  30.53 
 
 
679 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
291 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>