194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01253 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01253  transposase  100 
 
 		 159 aa  313  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  97.97 
 
 		 322 aa  286  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  96.88 
 
 		 267 aa  249  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  89.87 
 
 		 159 aa  248  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  95.31 
 
 		 322 aa  247  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  95.31 
 
 		 322 aa  247  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  95.31 
 
 		 322 aa  246  8e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  93.75 
 
 		 322 aa  242  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  93.75 
 
 		 260 aa  241  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  93.75 
 
 		 322 aa  241  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  95.31 
 
 		 324 aa  240  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  92.97 
 
 		 322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  92.97 
 
 		 322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  92.97 
 
 		 322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  92.97 
 
 		 322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  92.97 
 
 		 322 aa  238  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  92.97 
 
 		 289 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  92.19 
 
 		 322 aa  236  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  91.41 
 
 		 322 aa  235  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  92.19 
 
 		 197 aa  235  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  99.07 
 
 		 108 aa  209  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  92.47 
 
 		 299 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02862  transposase  91.89 
 
 		 104 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04492  transposase, IS30 family  81.43 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  39.33 
 
 		 315 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  35.9 
 
 		 313 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  35.9 
 
 		 313 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  38 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  38 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  38 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  38 
 
 		 315 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  35.26 
 
 		 313 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  37.24 
 
 		 317 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  37.24 
 
 		 246 aa  84.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  35.26 
 
 		 313 aa  84.7  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  37.32 
 
 		 313 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  94.59 
 
 		 249 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 335 aa  77.4  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 335 aa  77.4  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  34.18 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  96 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  41.76 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  38.12 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  35.11 
 
 		 346 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  36.5 
 
 		 386 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  37.89 
 
 		 342 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  37.08 
 
 		 251 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 		 332 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  33.95 
 
 		 380 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  35.48 
 
 		 336 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  31.45 
 
 		 327 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  37.11 
 
 		 340 aa  50.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4441  transposase, ISlxx5  37.76 
 
 		 313 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  33.95 
 
 		 385 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  36.2 
 
 		 385 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  30.43 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  30.43 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  30.43 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1344  IS30 family transposase  34.43 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  38.83 
 
 		 342 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  36.02 
 
 		 385 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  38.14 
 
 		 408 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  34.39 
 
 		 339 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  39.58 
 
 		 383 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  39.58 
 
 		 320 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>