More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1344 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1344  IS30 family transposase  100 
 
 		 209 aa  430  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  34.72 
 
 		 315 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  33.49 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  34.12 
 
 		 315 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 315 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  34.12 
 
 		 315 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  35.98 
 
 		 339 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 		 315 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  36.67 
 
 		 380 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  34.11 
 
 		 313 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6282  integrase catalytic subunit  33.18 
 
 		 339 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2842  integrase catalytic subunit  33.18 
 
 		 339 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4004  transposase for insertion sequence element IS1086  33.18 
 
 		 339 aa  94  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  33.64 
 
 		 313 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  35.71 
 
 		 380 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  35.21 
 
 		 385 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  33.18 
 
 		 313 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0356  IS30 family transposase  34.97 
 
 		 309 aa  92  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1811  IS30 family transposase  34.97 
 
 		 309 aa  92  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0307  IS30 family transposase  34.97 
 
 		 309 aa  91.3  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  37.56 
 
 		 320 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  34.27 
 
 		 385 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  36.57 
 
 		 273 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  37.56 
 
 		 383 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  34.74 
 
 		 385 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1723  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1090  transposase  31.94 
 
 		 288 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1466  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.163454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0519  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1637  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0259  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0454  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1082  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0164  transposase  31.94 
 
 		 318 aa  89  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  37.09 
 
 		 374 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  37.09 
 
 		 374 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 335 aa  87.8  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 335 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_62  putative integrase  30.62 
 
 		 321 aa  87  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 335 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 335 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 335 aa  87  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0698  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0692  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0588  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3181  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.293838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2715  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000216698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2188  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1206  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0879  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2153  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0226722  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1496  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1392  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0906223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2114  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0192  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0304  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0025223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0348  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000266386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1999  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0510  integrase catalytic subunit  31.05 
 
 		 356 aa  86.3  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3005  integrase catalytic region  32.85 
 
 		 326 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3004  integrase catalytic region  32.85 
 
 		 326 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1557  integrase catalytic region  32.85 
 
 		 326 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0883  integrase catalytic region  32.85 
 
 		 326 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  33.5 
 
 		 316 aa  85.5  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  37.02 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  30.39 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>