180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00677 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  100 
 
 
267 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  96.88 
 
 
159 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  96.88 
 
 
322 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  96.88 
 
 
322 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  96.88 
 
 
322 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  96.88 
 
 
322 aa  248  6e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  93.75 
 
 
322 aa  240  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  92.19 
 
 
159 aa  238  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  92.19 
 
 
260 aa  237  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  93.75 
 
 
324 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  93.75 
 
 
197 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  92.19 
 
 
322 aa  236  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  91.41 
 
 
322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  91.41 
 
 
322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  91.41 
 
 
322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  91.41 
 
 
322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  91.41 
 
 
322 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  91.41 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  91.41 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  97.22 
 
 
108 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00579  transposase  92.47 
 
 
299 aa  171  7.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02862  transposase  91.89 
 
 
104 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04492  transposase, IS30 family  78.57 
 
 
88 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4400  integrase catalytic subunit  39.07 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4557  integrase catalytic region  36.25 
 
 
313 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.839821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0672  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0912  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1076  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1268  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.813238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1511  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1571  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1634  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.891352  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2043  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.111705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2109  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2138  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2153  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000207215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3555  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3627  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3684  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3686  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3739  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3746  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3870  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3948  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4040  integrase catalytic subunit  36.25 
 
 
313 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1322  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 
313 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  37.5 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0783  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.1506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  37.09 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  37.09 
 
 
315 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01240  transposase  94.59 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.839107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0238  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1574  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3589  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0037  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0038  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0401  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1879  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2262  integrase catalytic subunit  35.1 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4230  IS30 family transposase  36.64 
 
 
346 aa  60.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382634  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04491  transposase  96 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4284  integrase catalytic subunit  40 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  44.55 
 
 
342 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  38.24 
 
 
386 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5954  transposase ISRme10  36.59 
 
 
336 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  38.51 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2645  integrase catalytic subunit  37.63 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  35.48 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2294  integrase catalytic region  29.87 
 
 
316 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  34.59 
 
 
380 aa  52.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4441  transposase, ISlxx5  38.24 
 
 
313 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1344  IS30 family transposase  36.89 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4656  integrase catalytic region  30.77 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.224377  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4338  Integrase catalytic region  30.77 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.97265  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4403  integrase catalytic region  30.77 
 
 
290 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.291607  normal  0.47214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0052  putative transposase  36.8 
 
 
340 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  36.3 
 
 
385 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  34.57 
 
 
370 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0141  integrase catalytic subunit  31.69 
 
 
327 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  38.83 
 
 
342 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  38.46 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1990  integrase catalytic region  35.03 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.653928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  33.96 
 
 
380 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  36 
 
 
385 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  36 
 
 
385 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>