52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04492 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04492  transposase, IS30 family  100 
 
 		 88 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02075  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04719  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.061639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00702  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00233  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03346  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  110  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05593  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 260 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119198  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02275  transposase  96.49 
 
 		 289 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01251  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03884  IS1112 transposase  96.49 
 
 		 322 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03989  IS1112 transposase  81.43 
 
 		 322 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00109  transposase  94.74 
 
 		 324 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01253  transposase  81.43 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03302  transposase, IS30 family  81.43 
 
 		 108 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00803  IS1112 transposase  92.98 
 
 		 322 aa  107  6e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0987141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03519  IS1112 transposase  78.57 
 
 		 322 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03216  IS1112 transposase  78.57 
 
 		 322 aa  105  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02914  transposase  81.43 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04791  IS1112 transposase  78.57 
 
 		 322 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.030193  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00677  IS1112 transposase  78.57 
 
 		 267 aa  105  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16701  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01635  IS1112 transposase  87.72 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.085128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01527  IS1112 transposase  87.72 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374623  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04709  IS1112 transposase  87.72 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04691  IS1112 transposase  87.72 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02992  IS1112 transposase  87.72 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03201  IS1112 transposase  87.72 
 
 		 322 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00575  transposase  87.72 
 
 		 197 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04853  IS1112 transposase  85.96 
 
 		 322 aa  98.6  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0362678  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0694  Integrase catalytic region  51.85 
 
 		 421 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0907  Integrase catalytic region  54.35 
 
 		 408 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13211  transposase  53.33 
 
 		 394 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.562916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4441  transposase, ISlxx5  52.17 
 
 		 313 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1311  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  58.54 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  58.54 
 
 		 320 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  58.54 
 
 		 383 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3886  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  58.54 
 
 		 251 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  56.1 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0939  Integrase catalytic region  50 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.993128  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  56.1 
 
 		 374 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2677  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  58.97 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.151074  normal  0.0236339 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4339  integrase catalytic subunit  52.17 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2359  integrase catalytic subunit  42 
 
 		 332 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.747939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  55 
 
 		 386 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 386 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3208  integrase catalytic subunit  48.72 
 
 		 356 aa  40  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>