More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4106 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.18 
 
 		 601 aa  710    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.39 
 
 		 598 aa  650    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2263  acyl-CoA dehydrogenase family protein  59.51 
 
 		 606 aa  745    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3891  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  73.72 
 
 		 606 aa  931    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  57.45 
 
 		 601 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.5 
 
 		 598 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.17 
 
 		 601 aa  721    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  57.95 
 
 		 601 aa  703    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0137  acyl-CoA dehydrogenase  63.38 
 
 		 606 aa  831    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.49 
 
 		 597 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.34 
 
 		 599 aa  720    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  59.01 
 
 		 601 aa  720    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.02 
 
 		 601 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.36 
 
 		 598 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  58.51 
 
 		 601 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.83 
 
 		 601 aa  711    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.04 
 
 		 595 aa  695    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  60.7 
 
 		 601 aa  725    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4106  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 606 aa  1250    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.39 
 
 		 603 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0148  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.55 
 
 		 606 aa  832    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.82 
 
 		 597 aa  653    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.22 
 
 		 606 aa  820    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47600  putative acyl-CoA dehydrogenase  97.03 
 
 		 606 aa  1217    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.5 
 
 		 598 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  60.66 
 
 		 606 aa  748    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  55.65 
 
 		 597 aa  661    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.04 
 
 		 601 aa  706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.88 
 
 		 598 aa  663    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.18 
 
 		 601 aa  710    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  58.18 
 
 		 601 aa  710    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  51.49 
 
 		 599 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.41 
 
 		 600 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.29 
 
 		 594 aa  578  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.67 
 
 		 596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.16 
 
 		 597 aa  568  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  49.75 
 
 		 597 aa  570  1e-161  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  50.86 
 
 		 595 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.95 
 
 		 594 aa  572  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  49.34 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49 
 
 		 595 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 595 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.84 
 
 		 597 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50 
 
 		 595 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  48.84 
 
 		 597 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.93 
 
 		 595 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 595 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 595 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.43 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.43 
 
 		 599 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  49.42 
 
 		 597 aa  561  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.43 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.43 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.66 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.34 
 
 		 597 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.01 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.11 
 
 		 598 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.68 
 
 		 595 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  51.03 
 
 		 596 aa  554  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.6 
 
 		 598 aa  555  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.54 
 
 		 596 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.83 
 
 		 593 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.25 
 
 		 596 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.6 
 
 		 601 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.44 
 
 		 595 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  46.8 
 
 		 596 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  49.26 
 
 		 596 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.09 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.19 
 
 		 595 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0804  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.36 
 
 		 596 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5238  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.33 
 
 		 597 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.94 
 
 		 592 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0380  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.52 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  47.61 
 
 		 592 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  50.83 
 
 		 593 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.86 
 
 		 592 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.11 
 
 		 592 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.59 
 
 		 590 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.77 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.78 
 
 		 592 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.95 
 
 		 592 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5930  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.84 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.36 
 
 		 595 aa  532  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0962  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.14 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 		 589 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3957  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.11 
 
 		 598 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.574903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.45 
 
 		 592 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.44 
 
 		 600 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.54 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.93 
 
 		 626 aa  535  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68510  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.67 
 
 		 596 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0032913  normal  0.251007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.01 
 
 		 589 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.66 
 
 		 592 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.755851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  49.34 
 
 		 591 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>