More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.85 
 
 		 601 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0912  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.82 
 
 		 597 aa  654    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1177  acyl-CoA dehydrogenase family protein  53.55 
 
 		 598 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.158836  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2263  acyl-CoA dehydrogenase family protein  59.8 
 
 		 606 aa  747    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3891  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  74.71 
 
 		 606 aa  946    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0500  acyl-CoA dehydrogenase family protein  56.69 
 
 		 601 aa  694    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.837085  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06620  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.66 
 
 		 598 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06600  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.68 
 
 		 601 aa  715    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4681  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  57.21 
 
 		 601 aa  697    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0137  acyl-CoA dehydrogenase  63.64 
 
 		 606 aa  833    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0965  putative acyl-CoA dehydrogenase  54.32 
 
 		 597 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.314138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0398  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.85 
 
 		 601 aa  707    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.257074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0606  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.51 
 
 		 601 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5167  Acyl-CoA dehydrogenase-like  56.36 
 
 		 598 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5170  Acyl-CoA dehydrogenase-like  58.18 
 
 		 601 aa  715    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131109  normal  0.317042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2750  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  59.34 
 
 		 599 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000084613  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4834  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.52 
 
 		 601 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.649579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4106  putative acyl-CoA dehydrogenase  97.03 
 
 		 606 aa  1217    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1885  putative acyl-CoA dehydrogenase  58.04 
 
 		 595 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47600  putative acyl-CoA dehydrogenase  100 
 
 		 606 aa  1253    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0394  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.85 
 
 		 601 aa  707    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2431  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  55.72 
 
 		 603 aa  653    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1571  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.69 
 
 		 601 aa  699    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000982993 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0148  acyl-CoA dehydrogenase-like  63.8 
 
 		 606 aa  835    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1452  acyl-CoA dehydrogenase-like  54.65 
 
 		 597 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4081  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.5 
 
 		 601 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1408  acyl-CoA dehydrogenase-like  60.82 
 
 		 606 aa  752    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45920  acyl-CoA dehydrogenase  60.53 
 
 		 601 aa  726    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0607  putative acyl-CoA dehydrogenase  60.66 
 
 		 598 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0116  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  63.8 
 
 		 606 aa  832    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2039  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  54.71 
 
 		 598 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02316  Acyl-CoA dehydrogenase  52.15 
 
 		 599 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.254784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1918  acyl-CoA dehydrogenase-like  51.74 
 
 		 600 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.477774  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1741  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  52.57 
 
 		 594 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0007  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.34 
 
 		 596 aa  578  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.419421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3278  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  51.82 
 
 		 597 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.556327  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0599  acyl-CoA dehydrogenase  50.25 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1754  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.17 
 
 		 594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0420795 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0795  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.34 
 
 		 597 aa  569  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0746  acyl-CoA dehydrogenase family protein  49.34 
 
 		 597 aa  569  1e-161  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.398029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01173  acyl-CoA dehydrogenase  49.09 
 
 		 597 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.520854  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4038  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase  50.95 
 
 		 595 aa  567  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922091  normal  0.0585748 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0473  putative acyl-CoA dehydrogenase oxidoreductase protein  49.5 
 
 		 595 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.390432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4033  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.84 
 
 		 597 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.795877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0213  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.76 
 
 		 598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  49.09 
 
 		 598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0661  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.84 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09630  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.14 
 
 		 593 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.806665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2777  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.58 
 
 		 596 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.932954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0197  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.5 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.908056  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.1 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.139086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0680  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.26 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.26 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2748  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.5 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2410  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.5 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2330  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.5 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1308  Acyl-CoA dehydrogenase  51.27 
 
 		 596 aa  558  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.135322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2721  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.1 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.440911  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0695  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.26 
 
 		 595 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0146  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.17 
 
 		 598 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.986474  normal  0.238183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2109  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.1 
 
 		 595 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2639  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.26 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0601004  normal  0.257028 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6048  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.1 
 
 		 599 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0564  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.48 
 
 		 595 aa  555  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0348  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.68 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5238  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  50.66 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0363  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  48.51 
 
 		 595 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.84094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0385  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.43 
 
 		 595 aa  553  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.840786  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1337  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.25 
 
 		 601 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0815  putative acyl-CoA dehydrogenase  47.13 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.809407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0899  putative acyl-CoA dehydrogenase  51.32 
 
 		 593 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.183433  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4606  Acyl-CoA dehydrogenase-like  48.84 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.504166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3797  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.35 
 
 		 596 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0462  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.76 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.29438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0578  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.93 
 
 		 595 aa  551  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0396  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.11 
 
 		 592 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3819  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  50.08 
 
 		 590 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0804  acyl-CoA dehydrogenase-like  48.11 
 
 		 596 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0385  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.35 
 
 		 595 aa  547  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0446  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.02 
 
 		 595 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0400  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.85 
 
 		 592 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672876 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2368  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.17 
 
 		 589 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0370  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.94 
 
 		 592 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3554  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 		 589 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4677  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  47.53 
 
 		 592 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0983724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0380  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.52 
 
 		 596 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1537  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  47.19 
 
 		 600 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.564403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4079  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.27 
 
 		 592 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2220  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.68 
 
 		 594 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5166  Acyl-CoA dehydrogenase-like  47.21 
 
 		 592 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25210  acyl-CoA dehydrogenase  49.84 
 
 		 591 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.885326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2749  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.4 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.59666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4445  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.18 
 
 		 626 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744679  normal  0.0140421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0885  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  47.85 
 
 		 596 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.894915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0506  acyl-CoA dehydrogenase family protein  47.45 
 
 		 592 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5758  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  48.19 
 
 		 595 aa  535  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4832  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  47.28 
 
 		 592 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2665  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  49.17 
 
 		 592 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.755851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5930  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.34 
 
 		 596 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68510  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.17 
 
 		 596 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0032913  normal  0.251007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>