44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83776 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_83776  predicted protein  100 
 
 		 572 aa  1158    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  23.75 
 
 		 516 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  20.29 
 
 		 1831 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  20.94 
 
 		 618 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  20.58 
 
 		 1217 aa  53.9  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.3 
 
 		 1652 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.73 
 
 		 576 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  19.59 
 
 		 1807 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  21.65 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.14 
 
 		 1714 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21983  predicted protein  22.17 
 
 		 484 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.383606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.24 
 
 		 1004 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  20.25 
 
 		 696 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  18.18 
 
 		 589 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.55 
 
 		 1177 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.5 
 
 		 317 aa  47.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.68 
 
 		 1686 aa  47  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 		 1164 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.32 
 
 		 1161 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  21.19 
 
 		 1100 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.97 
 
 		 1364 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29180  predicted protein  24.59 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.648326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  20.16 
 
 		 1474 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1041 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.33 
 
 		 434 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.32 
 
 		 1161 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.34 
 
 		 1190 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.03 
 
 		 1039 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  20.33 
 
 		 924 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53071  predicted protein  25.65 
 
 		 935 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.43 
 
 		 1599 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.17 
 
 		 1711 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.14 
 
 		 1363 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  20.9 
 
 		 1163 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.49 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.04 
 
 		 1661 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  20.65 
 
 		 1357 aa  43.9  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.16 
 
 		 1188 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.43 
 
 		 1760 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.55 
 
 		 1196 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  18.47 
 
 		 1557 aa  43.9  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  20.43 
 
 		 1304 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 335 aa  43.5  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  22.46 
 
 		 1348 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>