123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69676 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_69676  biotin holocarboxylase synthetase  100 
 
 
675 aa  1387    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06055  biotin apo-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09550)  40.6 
 
 
713 aa  479  1e-134  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00800  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase, putative  30.58 
 
 
789 aa  254  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0305  biotin apo-protein ligase-related protein  33.58 
 
 
259 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.568618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4499  biotin apo-protein ligase-related protein  31.93 
 
 
278 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119606  biotin holocarboxylase synthetase-like protein  27.16 
 
 
339 aa  103  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0286  hypothetical protein  30.53 
 
 
266 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2871  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  44.58 
 
 
269 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336309  normal  0.418687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 
333 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4404  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.91 
 
 
264 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  27.04 
 
 
319 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.41 
 
 
328 aa  56.6  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  25 
 
 
328 aa  57  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3659  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.49 
 
 
272 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.834466  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0002  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.65 
 
 
262 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  25.93 
 
 
320 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  25.93 
 
 
320 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  25.93 
 
 
320 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  25.93 
 
 
320 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  25.93 
 
 
320 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  27.59 
 
 
320 aa  55.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1022  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.94 
 
 
291 aa  55.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0775  transcriptional repressor of the biotin operon / biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase; RBL03563  26.56 
 
 
325 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000728901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1971  biotin-(acetyl-CoA carboxylase) holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  21.88 
 
 
327 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2894  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.8 
 
 
343 aa  54.3  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1200  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.74 
 
 
279 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.94 
 
 
267 aa  54.3  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4051  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.32 
 
 
272 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.141913  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  35.71 
 
 
320 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2045  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.96 
 
 
267 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3315  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.37 
 
 
256 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0935  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.81 
 
 
242 aa  52.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1071  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.68 
 
 
279 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  0.636766 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.09 
 
 
321 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  32.77 
 
 
326 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6247  biotin--protein ligase  23.91 
 
 
306 aa  52.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.791629 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  22.99 
 
 
332 aa  52.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  25.19 
 
 
320 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  25.47 
 
 
319 aa  52.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.63 
 
 
264 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
319 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
319 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
319 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2290  biotin--protein ligase  24.91 
 
 
306 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2904  biotin--protein ligase  24.91 
 
 
306 aa  51.2  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.125895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  24.44 
 
 
320 aa  51.2  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  25.37 
 
 
319 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2919  biotin--protein ligase  25.28 
 
 
306 aa  50.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  25.09 
 
 
319 aa  50.8  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0034  biotin apo-protein ligase-related protein  23.27 
 
 
277 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  26.12 
 
 
282 aa  50.4  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1005  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.96 
 
 
281 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  28.1 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  32.17 
 
 
333 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4128  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.79 
 
 
289 aa  49.7  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  26.11 
 
 
323 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2953  biotin--protein ligase  25.18 
 
 
306 aa  49.7  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3908  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.27 
 
 
270 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  31.58 
 
 
320 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  24.69 
 
 
317 aa  48.9  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  32.46 
 
 
319 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1967  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.79 
 
 
262 aa  48.9  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  32.46 
 
 
319 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  32.46 
 
 
319 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3227  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.85 
 
 
267 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  32.46 
 
 
319 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3253  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.83 
 
 
256 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.45 
 
 
322 aa  48.5  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  30.63 
 
 
320 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1295  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.82 
 
 
237 aa  48.5  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.486706  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0788  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.63 
 
 
318 aa  48.5  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0077  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.93 
 
 
327 aa  48.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2654  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.31 
 
 
343 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  30.7 
 
 
319 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0792  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  30.08 
 
 
266 aa  47.8  0.0006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0251004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  32.43 
 
 
321 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  26.05 
 
 
320 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_004310  BR0816  biotin--protein ligase  25.3 
 
 
265 aa  47.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0761  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.59 
 
 
249 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1036  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.75 
 
 
274 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.652597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1488  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.76 
 
 
322 aa  47  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.11548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  26.27 
 
 
319 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0811  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  25.3 
 
 
265 aa  47.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0205  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.9 
 
 
259 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.88267  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3352  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  24.68 
 
 
288 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.0000000222923  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2610  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  22.73 
 
 
335 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.808481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1476  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.64 
 
 
338 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.841583  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0857  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.66 
 
 
291 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.198933  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0700  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.09 
 
 
231 aa  46.6  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00112932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0724  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.09 
 
 
231 aa  46.6  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.217665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1586  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  25 
 
 
289 aa  45.8  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0263  biotin acetyl-CoA-carboxylase synthetase  24.8 
 
 
291 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>