167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50384 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_50384  predicted protein  100 
 
 		 269 aa  556  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32681  predicted protein  37.5 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14733  predicted protein  36.7 
 
 		 466 aa  122  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  27.72 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  36.52 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3077  peptide methionine sulfoxide reductase  37.39 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  28.87 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2741  peptide methionine sulfoxide reductase  30.53 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  27.72 
 
 		 177 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  30.22 
 
 		 208 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04210  protein-methionine-S-oxide reductase, putative  28.09 
 
 		 192 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.474903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  26.79 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0904  methionine sulfoxide reductase A  26.75 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.68103  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  34.78 
 
 		 175 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  27.43 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  28.16 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  28.37 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1873  peptide methionine sulfoxide reductase  30.59 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2992  peptide methionine sulfoxide reductase  30.68 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  28.96 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  30.05 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1991  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  33.64 
 
 		 309 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.145028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  28.42 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17601  peptide methionine sulfoxide reductase  26.32 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  28.42 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  29.82 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  28.57 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  27.81 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  32.52 
 
 		 165 aa  50.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06881  peptide methionine sulfoxide reductase  28.89 
 
 		 241 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.572964 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1937  peptide methionine sulfoxide reductase  29.44 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  25.45 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1857  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  31.82 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2595  peptide methionine sulfoxide reductase  31.3 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1884  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  31.82 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1532  peptide methionine sulfoxide reductase  29.41 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.58481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2435  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  31.82 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.759859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  27.96 
 
 		 183 aa  49.3  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2923  peptide methionine sulfoxide reductase  34.4 
 
 		 191 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.634887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  28.21 
 
 		 186 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13871  peptide methionine sulfoxide reductase  25.51 
 
 		 211 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.370801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1891  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  31.82 
 
 		 302 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.860262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  29.27 
 
 		 222 aa  49.3  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  26.72 
 
 		 211 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1960  peptide methionine sulfoxide reductase  31.3 
 
 		 186 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.723901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2571  peptide methionine sulfoxide reductase  31.3 
 
 		 186 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  29.48 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4166  peptide methionine sulfoxide reductase  25.74 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  26.82 
 
 		 184 aa  48.9  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  30 
 
 		 186 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0714  peptide methionine sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1762  peptide methionine sulfoxide reductase  29.41 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6004  methionine sulfoxide reductase A  29.71 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0902555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4676  methionine sulfoxide reductase A  26.9 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0254  peptide methionine sulfoxide reductase  25.71 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.275459  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2098  peptide methionine sulfoxide reductase  28.82 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1980  peptide methionine sulfoxide reductase  29.17 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  28.09 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1754  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  30 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.229998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0725  peptide methionine sulfoxide reductase  31.3 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1523  peptide methionine sulfoxide reductase  27.83 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  28.57 
 
 		 338 aa  47  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2184  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  30.91 
 
 		 301 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2261  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  30.91 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  28.02 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2814  peptide methionine sulfoxide reductase  30.9 
 
 		 179 aa  47.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  29.57 
 
 		 334 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1856  methionine sulfoxide reductase A  29.52 
 
 		 238 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  32.46 
 
 		 176 aa  47  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0356  peptide methionine sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0154323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5903  protein-methionine-S-oxide reductase  30.43 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.478627 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  27.54 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5321  methionine sulfoxide reductase A  32.95 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0646  peptide methionine sulfoxide reductase  29.38 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00553466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  30.88 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1476  peptide methionine sulfoxide reductase  28.09 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  27.27 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  27.07 
 
 		 164 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10381  peptide methionine sulfoxide reductase  27.12 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.794772  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  30.7 
 
 		 183 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2491  peptide methionine sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0103  peptide methionine sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 185 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0127961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4771  methionine sulfoxide reductase A  31.18 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1950  peptide methionine sulfoxide reductase  28.5 
 
 		 173 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  27.07 
 
 		 159 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1148  peptide methionine sulfoxide reductase  29.63 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5394  peptide methionine sulfoxide reductase  31.4 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0620596  normal  0.018665 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  23.14 
 
 		 359 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3055  peptide methionine sulfoxide reductase  27.54 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195694 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1058  peptide methionine sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2393  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  30.91 
 
 		 301 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0655  peptide methionine sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0900  methionine-S-sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0413553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  30.7 
 
 		 153 aa  45.8  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  26.52 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3157  peptide methionine sulfoxide reductase  29.44 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0897  methionine-S-sulfoxide reductase  30.51 
 
 		 287 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173058  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  28.82 
 
 		 150 aa  45.8  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0340  peptide methionine sulfoxide reductase  26.7 
 
 		 226 aa  45.4  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.663194  normal  0.844537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1687  peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB  28.32 
 
 		 170 aa  45.4  0.0009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>