23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32681 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32681  predicted protein  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50384  predicted protein  37.5 
 
 		 269 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14733  predicted protein  35.78 
 
 		 466 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0821  methionine sulfoxide reductase A  30.81 
 
 		 212 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2127  methionine sulfoxide reductase A  28.47 
 
 		 212 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06881  peptide methionine sulfoxide reductase  31.76 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.572964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2678  methionine sulfoxide reductase A  33.63 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.199403  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1866  peptide methionine sulfoxide reductase  29.67 
 
 		 211 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0773465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  30.18 
 
 		 159 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  28.18 
 
 		 165 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1091  peptide methionine sulfoxide reductase  25.93 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2588  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  31.15 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  21.9 
 
 		 213 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0844  peptide methionine sulfoxide reductase  28.35 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  33.04 
 
 		 186 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001695  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  25.84 
 
 		 212 aa  42.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3771  methionine sulfoxide reductase A  27.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3961  methionine sulfoxide reductase A  27.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3626  methionine sulfoxide reductase A  27.22 
 
 		 212 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  28.49 
 
 		 225 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  27.22 
 
 		 159 aa  42.4  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  27.17 
 
 		 266 aa  42.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1311  methionine sulfoxide reductase A  29.48 
 
 		 237 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.518036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>