145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46365 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46365  predicted protein  100 
 
 		 419 aa  867    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207077  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  77.94 
 
 		 519 aa  627  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46336  predicted protein  43.47 
 
 		 455 aa  294  2e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26635  predicted protein  39.12 
 
 		 374 aa  281  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46360  predicted protein  39.88 
 
 		 380 aa  245  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  29.09 
 
 		 425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  33.33 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  28.69 
 
 		 309 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  28.27 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  29.58 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  28.67 
 
 		 315 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  29.05 
 
 		 287 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  29.39 
 
 		 302 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  29.8 
 
 		 321 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  28.8 
 
 		 305 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  27.95 
 
 		 305 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  29.26 
 
 		 308 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  28.1 
 
 		 293 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  25.33 
 
 		 310 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  28.93 
 
 		 300 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  25.33 
 
 		 310 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  29 
 
 		 300 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  29.29 
 
 		 318 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  28.14 
 
 		 295 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  30.43 
 
 		 308 aa  90.1  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  29.11 
 
 		 289 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  27.97 
 
 		 290 aa  89.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  26.14 
 
 		 303 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  27.16 
 
 		 295 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  29.36 
 
 		 300 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  28.39 
 
 		 306 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  26.34 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  27.36 
 
 		 314 aa  87.4  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  29.48 
 
 		 306 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  29.08 
 
 		 309 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  29.15 
 
 		 303 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  26.32 
 
 		 309 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  29.28 
 
 		 306 aa  87.4  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45917  predicted protein  23.98 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  26.35 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  28.51 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  29.88 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  25.18 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  28.9 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  27.76 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  25.98 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  29.1 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  27.78 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  29.73 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  24.21 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  29.28 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  29.26 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  28.77 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  24.56 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  25.75 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  28.63 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  29.28 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  28.74 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  25.65 
 
 		 314 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  27.17 
 
 		 327 aa  79.7  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  27.03 
 
 		 318 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  29.17 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  25 
 
 		 291 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  26.67 
 
 		 303 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  28.34 
 
 		 303 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  28.35 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  27.42 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  28.35 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  28.35 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  27.65 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  28.35 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  28.35 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  25.38 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  26.72 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  25.38 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  31.09 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  30.6 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  28.08 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  24.78 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  26.19 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  27.94 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46385  predicted protein  23.51 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.28 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  28.69 
 
 		 286 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  26.58 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  27.95 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  29.79 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  27.95 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  25.31 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  26.09 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  28 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  23.51 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  25 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  25 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  27.31 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  27.16 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  26.67 
 
 		 305 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>