154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0608 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 
321 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  47.75 
 
 
325 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  48.81 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  45.18 
 
 
315 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  41.78 
 
 
318 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  43.73 
 
 
325 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  43 
 
 
314 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  43 
 
 
314 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  42.52 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  38.3 
 
 
300 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  33.69 
 
 
310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  34.4 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  31.31 
 
 
305 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  33.57 
 
 
304 aa  153  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  33.57 
 
 
304 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  151  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  33.57 
 
 
321 aa  152  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  33.57 
 
 
321 aa  152  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  33.57 
 
 
304 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  33.57 
 
 
321 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  31.69 
 
 
305 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  32.75 
 
 
306 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  37.34 
 
 
309 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  32.28 
 
 
308 aa  149  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  29.69 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  31.49 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  30.69 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  35.85 
 
 
314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  30.11 
 
 
308 aa  146  6e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  31.74 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  30.2 
 
 
303 aa  145  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  32.53 
 
 
305 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  31.27 
 
 
314 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  33.33 
 
 
312 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  32.39 
 
 
304 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  32.27 
 
 
303 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  29.59 
 
 
307 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  29.37 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  29.68 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  28.72 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  29.45 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  31.79 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  31.29 
 
 
306 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  31.19 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  28.67 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  29.82 
 
 
303 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  30.25 
 
 
309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  30.71 
 
 
277 aa  135  8e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  28.06 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  35.42 
 
 
308 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  28.88 
 
 
306 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  28.77 
 
 
303 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  28.09 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  27 
 
 
308 aa  132  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  32.04 
 
 
293 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  32.18 
 
 
299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  29.31 
 
 
296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  31.83 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  30.18 
 
 
305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  27.21 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  27.21 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  27.21 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  30.74 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  27.04 
 
 
306 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  27.01 
 
 
306 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  27.72 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  29.01 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  33.21 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  30 
 
 
290 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  26.69 
 
 
306 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  28.42 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  29.41 
 
 
321 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  27.78 
 
 
306 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  29.96 
 
 
306 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  27.78 
 
 
306 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  29.47 
 
 
306 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  36.84 
 
 
289 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  29.07 
 
 
306 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  28.73 
 
 
306 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  29.6 
 
 
306 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  29.45 
 
 
299 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  31.67 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  28.12 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  28.12 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  27.37 
 
 
302 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  29.86 
 
 
499 aa  118  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  27.34 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  28.36 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  27.02 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  29.07 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>