154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2042 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  55.36 
 
 		 287 aa  335  5.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  57.39 
 
 		 289 aa  325  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  53.2 
 
 		 293 aa  321  9.000000000000001e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  51.89 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  49.13 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  39.12 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  39.53 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  35.48 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  33.22 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  32.21 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  34.91 
 
 		 305 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  32.33 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  30.93 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  33.04 
 
 		 305 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  31.9 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  31.48 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  31.48 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  32.27 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  30.82 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  33.47 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  32.38 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  31.86 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  29.31 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  31.34 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  30.74 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  29.67 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  29.06 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  25.78 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  33.18 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  33.18 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  33.18 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  33.18 
 
 		 321 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  33.18 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  33.18 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  33.18 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  30.63 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  33.18 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  30.32 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  31 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  30.84 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  33.18 
 
 		 321 aa  122  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  27.78 
 
 		 299 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  29.79 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  31.67 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  30.18 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  27.65 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  32.61 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  29.28 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  26.48 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  30.97 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  34.05 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  25.26 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  28.67 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  29.73 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  31.06 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  24.41 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  27.92 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  27.98 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.93 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  28.88 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.95 
 
 		 303 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  29.58 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  27.93 
 
 		 299 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  30.34 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  24.57 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  30.34 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  30.21 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  30.21 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  30.21 
 
 		 306 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  30.47 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  28.51 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  29.91 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  28.28 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  25.67 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  27.71 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  30.16 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  29.96 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  28.81 
 
 		 325 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  28.88 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  30.07 
 
 		 305 aa  112  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  26.92 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  29.74 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  26.55 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  27.66 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  29 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  27.31 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  26.78 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  28.27 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  29.13 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  27.62 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>