155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3926 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  67.87 
 
 
305 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  50.5 
 
 
308 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  49.32 
 
 
315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  49.17 
 
 
303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  49.16 
 
 
318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  49.67 
 
 
308 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  48.03 
 
 
306 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  46.05 
 
 
303 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  47.32 
 
 
306 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  47.04 
 
 
306 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  47.44 
 
 
306 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  46.8 
 
 
306 aa  285  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  47.14 
 
 
306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  47.1 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  47.1 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  46.76 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  46.13 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  46.13 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  46.13 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  46.42 
 
 
306 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  46.42 
 
 
306 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  45.12 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  45.7 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  46.76 
 
 
303 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  43.75 
 
 
312 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  46.23 
 
 
302 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  46.42 
 
 
303 aa  268  8e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  45.55 
 
 
302 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  46.28 
 
 
303 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  44.52 
 
 
305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  45.25 
 
 
306 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  39.13 
 
 
310 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  41 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  38.59 
 
 
308 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  38.72 
 
 
304 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  38.54 
 
 
304 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  38.72 
 
 
304 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  38.72 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  38.72 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  38.72 
 
 
304 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  38.72 
 
 
304 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  38.72 
 
 
304 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  37.71 
 
 
308 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  38.38 
 
 
321 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  39.46 
 
 
308 aa  230  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  37.21 
 
 
304 aa  229  5e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  37.26 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  37.46 
 
 
315 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  36.69 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  36.01 
 
 
309 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  37.92 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  35.92 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  38.08 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  35.6 
 
 
307 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  35.18 
 
 
306 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  33.55 
 
 
298 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  36.3 
 
 
304 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  33.99 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  33.99 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  33.01 
 
 
299 aa  195  7e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  33.99 
 
 
299 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  36.27 
 
 
303 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  33.01 
 
 
299 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  37.55 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  37.55 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  34.49 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  35.17 
 
 
306 aa  182  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  34.93 
 
 
306 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  34.83 
 
 
306 aa  180  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  34.73 
 
 
306 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  33.22 
 
 
315 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  34.63 
 
 
300 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  34.47 
 
 
307 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  33.45 
 
 
310 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  32.04 
 
 
321 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  33.68 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  32.08 
 
 
287 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  32.17 
 
 
327 aa  159  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  33.57 
 
 
290 aa  159  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  34.65 
 
 
309 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  32.66 
 
 
295 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  32.87 
 
 
318 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  29.51 
 
 
303 aa  157  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  33.91 
 
 
296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  31.95 
 
 
295 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  32.28 
 
 
309 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  33.09 
 
 
300 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  31.8 
 
 
302 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  30.77 
 
 
305 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  30.45 
 
 
277 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  31.77 
 
 
314 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  33.33 
 
 
272 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>