155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0993 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  41.3 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  39.35 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  36.07 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  36.49 
 
 		 293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  33.8 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  33.45 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  35.48 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  33.45 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  33.45 
 
 		 314 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  36.1 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  37.27 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  33.81 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  33.22 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  34.64 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  35.62 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  32.98 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  30.63 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  39.17 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  29.82 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  30.04 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  29.31 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  29.68 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  31.23 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  28.67 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  30.97 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  29.14 
 
 		 304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  33.04 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  30.26 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  33.62 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  27.43 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  30.07 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  28.42 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  28.83 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28.62 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  29.35 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  28.81 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  30.88 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  31.87 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  28.67 
 
 		 302 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  28.98 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  26.87 
 
 		 318 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  26.9 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  28.18 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  28.14 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  27.6 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  30.1 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  27.5 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  26.12 
 
 		 315 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  31.95 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  27.4 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  27.78 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  28.67 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  26.48 
 
 		 306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  34.35 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  36.32 
 
 		 325 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  26.62 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  27.11 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  25.78 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  25.52 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  29.89 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  26.62 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  26.15 
 
 		 303 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  28.47 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  31.47 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  26.33 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  29.52 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  33.05 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  26.04 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  27.37 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  27.72 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  32.64 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  32.64 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  32.64 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  32.64 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  32.64 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 		 390 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  32.48 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  32.48 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  32.48 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  30.63 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  27.27 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  27.11 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  27.21 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  26.88 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  29.54 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>