155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1301 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  50.69 
 
 
307 aa  306  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  48.42 
 
 
318 aa  267  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  46.42 
 
 
314 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  48.76 
 
 
315 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  46.42 
 
 
314 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  41.5 
 
 
325 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  41.1 
 
 
327 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  38.3 
 
 
321 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  41.05 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  38.35 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  38.01 
 
 
306 aa  175  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  34.69 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  36.92 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  34.3 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  31.97 
 
 
308 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  29.9 
 
 
315 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  32.42 
 
 
314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  31.19 
 
 
308 aa  152  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  30.85 
 
 
300 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  32.27 
 
 
299 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  33.22 
 
 
290 aa  150  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  30.65 
 
 
306 aa  148  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.38 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  29.11 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  29.15 
 
 
303 aa  145  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  28.67 
 
 
306 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  33.33 
 
 
299 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  32.6 
 
 
299 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  32.6 
 
 
299 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  32.04 
 
 
305 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  29.93 
 
 
312 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  30.72 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  29.07 
 
 
296 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  32.27 
 
 
298 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  29.41 
 
 
304 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  32.29 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  31.96 
 
 
287 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  29.61 
 
 
499 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  27.74 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  32.75 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  26.94 
 
 
315 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  28.77 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28.24 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  28.62 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06909  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 
390 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.997625  normal  0.453793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  27.87 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  31.08 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  28.17 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  28.19 
 
 
307 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  28.28 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  28.14 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  28.14 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  28.14 
 
 
306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  27.65 
 
 
304 aa  129  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  27.8 
 
 
306 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  32.07 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  26.25 
 
 
318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  30.03 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  28.43 
 
 
307 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  27.8 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  30.72 
 
 
286 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  27.3 
 
 
304 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  33.48 
 
 
277 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  27.3 
 
 
321 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  27.3 
 
 
321 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  27.3 
 
 
304 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  27.3 
 
 
304 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  28.67 
 
 
302 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  28.17 
 
 
308 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  27.3 
 
 
304 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  31.82 
 
 
306 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  27.3 
 
 
304 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  27.3 
 
 
304 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  28.82 
 
 
303 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  27.3 
 
 
321 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  31.14 
 
 
306 aa  122  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  32.44 
 
 
308 aa  122  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  28.95 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  29.05 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  30.38 
 
 
306 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  28.04 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  28.04 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  27.12 
 
 
306 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  29.63 
 
 
303 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  28.38 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 
303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  28.38 
 
 
306 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  28.38 
 
 
306 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  25.74 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  26.83 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  24.37 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  24.79 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  27.65 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  27.65 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  27.65 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>