153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2042 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  587  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  50.66 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  47.9 
 
 		 309 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  45.78 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  44.48 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  48.21 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  44.08 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  45.45 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  45.39 
 
 		 299 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  52.07 
 
 		 298 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  42.77 
 
 		 308 aa  254  9e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  47.71 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  42.07 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  50.33 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  44.48 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  44.59 
 
 		 314 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  43.75 
 
 		 299 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  46.08 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  48.37 
 
 		 304 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  45.34 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  49.83 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  46.75 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  49.49 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  44.01 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  39.41 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  41.61 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  39.4 
 
 		 321 aa  203  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  39.07 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  39.07 
 
 		 304 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  39.07 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  39.07 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  39.07 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  39.07 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  39.07 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  37.25 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  38.74 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  41.61 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  39.32 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  40.94 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  36.27 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  36.45 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  38.33 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  38.51 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  37 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  39.53 
 
 		 312 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  36.67 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  36.67 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  34.45 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  36.33 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  36.46 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  36.88 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  37.93 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  34.65 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  38.35 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  37.07 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  36.54 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  36.54 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  36.54 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  35.55 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  36.96 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  34.67 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  36.73 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  35.55 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  35 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  35 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  35.16 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  33.89 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  34.7 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  33.98 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  34.46 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  29.41 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 296 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  36.88 
 
 		 286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  32.51 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  31.82 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  32.95 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  34.51 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  33.46 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  33.19 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  28.37 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  30.18 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  31.77 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  32.75 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  27.92 
 
 		 305 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  29.56 
 
 		 277 aa  125  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  27.84 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  29.39 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  30.74 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  25.74 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  31.75 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  33.78 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  32.61 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  31.36 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  33.19 
 
 		 289 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  32.02 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>