150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3397 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  650    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  56.51 
 
 		 309 aa  347  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  54.48 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  53.66 
 
 		 302 aa  338  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  48.59 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  45.21 
 
 		 321 aa  265  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  41.32 
 
 		 297 aa  239  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  42.32 
 
 		 300 aa  225  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  36.47 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  31.76 
 
 		 305 aa  153  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  34.87 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  29.02 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  33.2 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  31.7 
 
 		 295 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  30.63 
 
 		 286 aa  145  9e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  29.71 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  29.62 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  29.03 
 
 		 295 aa  142  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  30.61 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  31.2 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  31.29 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  31.29 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  28.27 
 
 		 308 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  31.29 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  31.8 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  29.96 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  31.29 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  31.29 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  31.02 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  33.57 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  29.83 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  28.69 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28.48 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  31.25 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  26.45 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  29.14 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  28.06 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  29.67 
 
 		 307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  27.08 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  27 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.32 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  29.71 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  27.78 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  27.4 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  26.48 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  27.86 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  28.68 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.63 
 
 		 308 aa  123  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  27.14 
 
 		 306 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  28.63 
 
 		 307 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  27.87 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  29.79 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  28.57 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  27.08 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.01 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  25.72 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  26.71 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  26.1 
 
 		 299 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  28.01 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  26.8 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  25.99 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  28.27 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  26.22 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  28.06 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  27.78 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  26.57 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  26.28 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  26.57 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.09 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  26.57 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  26.57 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  26.57 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  26.88 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  26.57 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  26.57 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  30 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  28.57 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  26.22 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  30.71 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  26.18 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  25.81 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  25.09 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  28.02 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  27.3 
 
 		 299 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  27.6 
 
 		 318 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  28.35 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0042  hypothetical protein  30.83 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  25.85 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  27.5 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  24.82 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  27.5 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  30.83 
 
 		 519 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  28 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  27.17 
 
 		 306 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  27.54 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  23.96 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  25.1 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>