145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1275 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  40.87 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  38.8 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5442  hypothetical protein  37.14 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564208  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5562  membrane protein-like protein  37.14 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5790  membrane protein-like protein  36.74 
 
 		 333 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162832  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  34.59 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  33.88 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  32.41 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  32.57 
 
 		 315 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  32.69 
 
 		 305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  31.71 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  30.77 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  30.7 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  31.13 
 
 		 297 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  28.37 
 
 		 286 aa  133  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  32.01 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  30.21 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  28.39 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  27.76 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  25.96 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  28.81 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  26.5 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  28.15 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  26.87 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.08 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  27.87 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  28.99 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  25.89 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  29.14 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  26.6 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  26.86 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  28.32 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  27.22 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  27.3 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  27.16 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  27.16 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  27.16 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  27.16 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  26.4 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  27.16 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  27.16 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  27.16 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  27.16 
 
 		 321 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  25.82 
 
 		 306 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  27.05 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  27.16 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  24.75 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  25.71 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  27.46 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  27.64 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  25.61 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  27.05 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  26.91 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  25.09 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  27.27 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  27.54 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  26.67 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  26.65 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  28.14 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  27.76 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  27.74 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  25.41 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  28.06 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  27.82 
 
 		 305 aa  99.4  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  26.81 
 
 		 307 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  25.55 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  26.57 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  26.77 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  28.16 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  27.7 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  25.94 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  24.37 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  23.97 
 
 		 314 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  25.63 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  27.51 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  25.36 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  24.91 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  27.33 
 
 		 306 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  27.72 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  24.51 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  27.65 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  23.94 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  27.65 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  26.06 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  28.01 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  28.25 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  26.39 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  26.57 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  23.99 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  23.86 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>