146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2692 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  34.6 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  32.89 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  28.8 
 
 		 300 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  31.37 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  34.93 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  31.58 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  33.7 
 
 		 286 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  32.62 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  33.33 
 
 		 305 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  30.61 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  33.7 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  31.99 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  31.09 
 
 		 308 aa  143  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  33.21 
 
 		 272 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  28.77 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  32.09 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  26.14 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  34.53 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  33.93 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  33.93 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  31.27 
 
 		 314 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  32.7 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  33.08 
 
 		 307 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  33.57 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  33.57 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  33.81 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  33.81 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  33.81 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  33.45 
 
 		 321 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  31.09 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  34.81 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  29.46 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  29.73 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  30.04 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  30.04 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  32.09 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  30 
 
 		 295 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  30.04 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  27.44 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  27.65 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  29.28 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  30.12 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  31.1 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  28.3 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  30.03 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  31.34 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  30.52 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  29.59 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  29.55 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  30.21 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  31.21 
 
 		 306 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  30.26 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  29.48 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  28.91 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  29.89 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  28.91 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  31.7 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  26.37 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  29.31 
 
 		 306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  29.72 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  26.8 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  28.8 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  29.96 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5442  hypothetical protein  23.87 
 
 		 335 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564208  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  29.48 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  25.08 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  27.89 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  30.6 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  28.05 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  26.22 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  26.5 
 
 		 303 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  27.67 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  29.28 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  28.9 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  27.67 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  26.67 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  26.58 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  24.75 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5562  membrane protein-like protein  24.19 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  29.92 
 
 		 308 aa  92.4  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  27.05 
 
 		 306 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  23.16 
 
 		 310 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  28.97 
 
 		 307 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  24.91 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  22.65 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0043  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5790  membrane protein-like protein  23.33 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162832  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  27.67 
 
 		 306 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  29.34 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  26.77 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  25.6 
 
 		 306 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  26.77 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  25.42 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  26.83 
 
 		 289 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  28.17 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>