143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0696 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5442  hypothetical protein  57.31 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564208  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  56.12 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5562  membrane protein-like protein  54.85 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5790  membrane protein-like protein  51.94 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162832  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  40.92 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  31.61 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  27.04 
 
 		 302 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  30.03 
 
 		 309 aa  142  9e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  29.77 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  26.63 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  26.9 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  28.37 
 
 		 321 aa  136  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  25.66 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  24.92 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  26.13 
 
 		 272 aa  129  9.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  26.9 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  24.55 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  26.23 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  26.62 
 
 		 310 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  27.74 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  28.32 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  24.26 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  27.02 
 
 		 305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  25.82 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  26.03 
 
 		 299 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  25.9 
 
 		 291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  27.33 
 
 		 307 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  24.91 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  27.6 
 
 		 303 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  24.59 
 
 		 295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  24.21 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  27 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  25.15 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  27.24 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.93 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  24.92 
 
 		 307 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  24.61 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  25.59 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  24.92 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  25.59 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  25.59 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  25.59 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  24.26 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  25.59 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  25.59 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  24.6 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  24.06 
 
 		 308 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  27.18 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  23.68 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  27.06 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  24.35 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  25.99 
 
 		 308 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  23.18 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  22.9 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  23.94 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  22.9 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  23.67 
 
 		 303 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  22.47 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  27.11 
 
 		 308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  22.58 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  24.7 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  22.32 
 
 		 318 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  22.37 
 
 		 299 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  21.43 
 
 		 315 aa  92.8  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  23.94 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  23.57 
 
 		 287 aa  92  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  26.24 
 
 		 305 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  23.72 
 
 		 305 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  23.34 
 
 		 290 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  23.32 
 
 		 309 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  22.97 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  24.22 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  25.25 
 
 		 321 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  22.18 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  22.96 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  23.24 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  23.25 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  23.36 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  23.79 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  23.25 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  21.4 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  22.3 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  25.75 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  20.71 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  21.07 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  20 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3057  hypothetical protein  24.91 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  21.34 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  21.48 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  21.69 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>