148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2577 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  71.58 
 
 		 314 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  70.71 
 
 		 314 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  62.95 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  64.56 
 
 		 300 aa  381  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  61.82 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  62.28 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  65.26 
 
 		 297 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  63.05 
 
 		 295 aa  362  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  62.67 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  66.19 
 
 		 323 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  42.75 
 
 		 272 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  37.59 
 
 		 286 aa  199  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  38.72 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  32.75 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  32.95 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  29.21 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  30.71 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  30.11 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  32.23 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  33.58 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  31.56 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  31.7 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  32.22 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  31.21 
 
 		 299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  29.8 
 
 		 305 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  36.02 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  30.34 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  30.5 
 
 		 299 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  33.06 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  30.34 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  30.92 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  33.19 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  35.27 
 
 		 315 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  29.46 
 
 		 299 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  30.53 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  29.96 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  33.08 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  29.96 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  29.96 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  29.96 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  29.96 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  29.96 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  30.55 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  32.78 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  31.93 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  30.08 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  30.17 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  29.41 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  30.38 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  31.65 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  31.84 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  28.21 
 
 		 302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.46 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  32.76 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  29.73 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  31.02 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  31.03 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  28.76 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  30.21 
 
 		 307 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  28.98 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.29 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  29.8 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  30.32 
 
 		 306 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  30.04 
 
 		 315 aa  125  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  29.9 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  29.96 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  28.52 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  29.84 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  31.85 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  29.25 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  29.89 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  31.09 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  30.69 
 
 		 306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  25.65 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  29.11 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  29.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  29.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  29.84 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  29.6 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  32.69 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  29.84 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  28.15 
 
 		 307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  26.32 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  27.68 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  26.81 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  29.67 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  29.3 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  28.52 
 
 		 303 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  29.75 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>