145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46336 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46336  predicted protein  100 
 
 		 455 aa  940    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.281756  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26635  predicted protein  77.95 
 
 		 374 aa  561  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  39.72 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46365  predicted protein  43.47 
 
 		 419 aa  294  3e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207077  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46360  predicted protein  39.83 
 
 		 380 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  29.39 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  32.43 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  30.25 
 
 		 306 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45917  predicted protein  25.07 
 
 		 499 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  30.68 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  31.56 
 
 		 307 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  30.14 
 
 		 309 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  31.78 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  30.47 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  31.23 
 
 		 325 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.81 
 
 		 310 aa  87  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  28.98 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  28.64 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  27.62 
 
 		 305 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  26.24 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  28.69 
 
 		 327 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  30.61 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  30.61 
 
 		 314 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  27.71 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  30.12 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  30.96 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  27.86 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  26.69 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  28.41 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  28.63 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  27.18 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  27.42 
 
 		 308 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  27.05 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  30.73 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  27.57 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  28.26 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.95 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  28.22 
 
 		 306 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  26.4 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  29.8 
 
 		 305 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  27.15 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  26.61 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  28.92 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  27.6 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  27.18 
 
 		 299 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  28.99 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  27.24 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  27.24 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  23.83 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  26 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  24.58 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  26.98 
 
 		 307 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  26.55 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  25.3 
 
 		 306 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  25.43 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  27.84 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  28.35 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  26.04 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  25.31 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  29.61 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  24.14 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  22.78 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  24.75 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  27.6 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  25.9 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  27.23 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  27.6 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  29.71 
 
 		 306 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  25.23 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  27.8 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  25.38 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  28.81 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  27.24 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  26.81 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  28.57 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  27.6 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  25.6 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  27.5 
 
 		 289 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  26.32 
 
 		 286 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1856  protein of unknown function UPF0187  27.62 
 
 		 308 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  26.43 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  26.55 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  27.24 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  27.24 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  27.24 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  27.24 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.81 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  27.41 
 
 		 315 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  28.15 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>