145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46385 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46385  predicted protein  100 
 
 
476 aa  981    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45917  predicted protein  47.18 
 
 
499 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147124  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87902  predicted protein  28.23 
 
 
425 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0889965  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  27.84 
 
 
307 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  26.88 
 
 
327 aa  97.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  26.63 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  26.63 
 
 
314 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0545  protein of unknown function UPF0187  25.64 
 
 
325 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.21 
 
 
310 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  26.81 
 
 
321 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  23.86 
 
 
305 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  25.32 
 
 
308 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  26.5 
 
 
300 aa  87  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  25.57 
 
 
306 aa  87  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  24.83 
 
 
303 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02251  UPF0187 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_5G06660)  23.66 
 
 
499 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.493837  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  21.91 
 
 
293 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  25.42 
 
 
306 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  25.42 
 
 
306 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  25.17 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  23.43 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  25.91 
 
 
309 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  26.23 
 
 
300 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46360  predicted protein  21.8 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.307461  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  25.42 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  24.58 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  24.58 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  23.57 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  25.35 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  24.93 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  25.56 
 
 
308 aa  79.7  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  23.57 
 
 
306 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  24.77 
 
 
302 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  23.15 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  21.6 
 
 
305 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  26.47 
 
 
321 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  22.73 
 
 
315 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  24.47 
 
 
307 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  21.61 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  24.11 
 
 
306 aa  77  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  24.28 
 
 
306 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  25.93 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  42.39 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46365  predicted protein  23.5 
 
 
419 aa  75.5  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.207077  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  24.35 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  22.35 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  22.09 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  22.18 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  22.74 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  23.91 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  23.91 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  25.09 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  23.91 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  24.32 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  26.26 
 
 
323 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  23.99 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  24.34 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  21.93 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46366  predicted protein  24.62 
 
 
519 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0951479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  24.55 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  23.85 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  25.26 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  20 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  24.72 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  25.08 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  26.26 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  23.56 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  22.07 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  22.79 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  22.74 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  24.58 
 
 
296 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  25.9 
 
 
295 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  24.21 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  22.74 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  23.48 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  22.88 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  37.86 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  22.9 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  21.99 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  22.9 
 
 
300 aa  67  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  23.55 
 
 
299 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  25.09 
 
 
305 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  23.81 
 
 
303 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  25.27 
 
 
297 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  22.26 
 
 
299 aa  65.1  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  22.76 
 
 
315 aa  64.3  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  33 
 
 
303 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33009  predicted protein  26.71 
 
 
895 aa  63.5  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.534008 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26635  predicted protein  24.79 
 
 
374 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  31.13 
 
 
286 aa  63.5  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4406  protein of unknown function UPF0187  24.38 
 
 
325 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  23.26 
 
 
306 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  21.66 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  21.66 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  21.66 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  21.66 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  21.66 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  21.3 
 
 
302 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  21.66 
 
 
302 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>