More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14713 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_14713  predicted protein  100 
 
 		 137 aa  285  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798626  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 142 aa  140  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  49.24 
 
 		 142 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  50.75 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  49.62 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4950  50S ribosomal protein L13  47.41 
 
 		 147 aa  131  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  0.643996 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  49.63 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  50.37 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 145 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  48.12 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  48.09 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1164  50S ribosomal protein L13  50.74 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  51.11 
 
 		 144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  48.15 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  49.25 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 142 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  50 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  47.41 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  47.1 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1625  50S ribosomal protein L13  47.01 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.971698  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19781  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17401  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  44.44 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  47.79 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  47.52 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1235  50S ribosomal protein L13  47.79 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  43.26 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  43.26 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  47.76 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  47.1 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  46.56 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1729  50S ribosomal protein L13  51.54 
 
 		 150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000044906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  44.85 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  49.61 
 
 		 144 aa  127  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0869  ribosomal protein L13  46.97 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  49.65 
 
 		 148 aa  126  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  48.15 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  46.32 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  47.1 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1536  50S ribosomal protein L13  50.79 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000633501  normal  0.222947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  48.89 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  45.38 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  46.27 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  51.13 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0901  50S ribosomal protein L13  51.15 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.469735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  45.19 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20530  LSU ribosomal protein L13P  47.73 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.780175  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  45.65 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  46.38 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  44.62 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  49.63 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  45.45 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1685  ribosomal protein L13  46.67 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  45.8 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  48.55 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  47.1 
 
 		 147 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  46.67 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1941  ribosomal protein L13  49.26 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0022  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.550014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1651  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  45.19 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  46.38 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2631  50S ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  46.21 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  47.33 
 
 		 145 aa  124  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  49.21 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  47.37 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  47.37 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0422  50S ribosomal protein L13  44.44 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00538272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  47.1 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  44.27 
 
 		 144 aa  123  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  49.21 
 
 		 142 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008146  Mmcs_1130  50S ribosomal protein L13  43.7 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1157  50S ribosomal protein L13  43.7 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.341835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1147  50S ribosomal protein L13  43.7 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.774761  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0148  50S ribosomal protein L13  48.87 
 
 		 153 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  45.65 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  45.19 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  48.51 
 
 		 147 aa  123  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2176  50S ribosomal protein L13  47.06 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0862  50S ribosomal protein L13  46.67 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  43.38 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0787  50S ribosomal protein L13  51.91 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.945783  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4612  50S ribosomal protein L13  48.12 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0118736 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>