41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0451 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  93.97 
 
 		 232 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  80.29 
 
 		 226 aa  348  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  77.17 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0827  hypothetical protein  75.12 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3623  hypothetical protein  74.65 
 
 		 233 aa  310  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3494  hypothetical protein  74.65 
 
 		 233 aa  310  7.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0665  hypothetical protein  69.2 
 
 		 234 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  64.02 
 
 		 214 aa  279  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  278  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  67.16 
 
 		 562 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  67.16 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  66.67 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0686  aphA-like regulator  31.37 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000629381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  26.19 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  24.44 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  23.5 
 
 		 201 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0623  peripheral membrane protein  26.88 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.454122  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  24.58 
 
 		 406 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  24.87 
 
 		 394 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  24.87 
 
 		 406 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  24.87 
 
 		 407 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  23.35 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4786  hypothetical protein  28.77 
 
 		 485 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.434789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4963  hypothetical protein  28.77 
 
 		 472 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  22.22 
 
 		 353 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  22.22 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  22.22 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  22.22 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4910  hypothetical protein  29.66 
 
 		 485 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  20.79 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>