39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4989 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  434  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  99.53 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  99.53 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  99.53 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  99.53 
 
 		 214 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  88.79 
 
 		 214 aa  370  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  91.22 
 
 		 214 aa  367  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  91.22 
 
 		 562 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  90.73 
 
 		 214 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  66.99 
 
 		 232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  66.18 
 
 		 232 aa  291  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  63.94 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3494  hypothetical protein  65.89 
 
 		 233 aa  278  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3623  hypothetical protein  65.89 
 
 		 233 aa  278  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0827  hypothetical protein  65.42 
 
 		 233 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  66.03 
 
 		 223 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0665  hypothetical protein  64.73 
 
 		 234 aa  247  8e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0686  aphA-like regulator  27.78 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000629381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  28.14 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  26.23 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  26.11 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0623  peripheral membrane protein  25.7 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.454122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  26.2 
 
 		 343 aa  48.9  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  25.93 
 
 		 406 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  25.93 
 
 		 394 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  25.93 
 
 		 406 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  25.93 
 
 		 407 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  24.19 
 
 		 356 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  25.52 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  24.19 
 
 		 356 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  24.19 
 
 		 353 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 		 782 aa  42.4  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  23.37 
 
 		 230 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>