38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2818 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  100 
 
 		 343 aa  690    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  86.71 
 
 		 353 aa  524  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  84.88 
 
 		 344 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  85.67 
 
 		 356 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  85.67 
 
 		 356 aa  497  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  59.95 
 
 		 407 aa  421  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  61.52 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  58.72 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  75.67 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  78.2 
 
 		 248 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  76.85 
 
 		 370 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  68.86 
 
 		 244 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  71.36 
 
 		 221 aa  315  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  79.51 
 
 		 274 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  60.93 
 
 		 230 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  55.05 
 
 		 198 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  24.58 
 
 		 226 aa  52.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  25.35 
 
 		 230 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  23.76 
 
 		 232 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  26.23 
 
 		 214 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  26.2 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  26.09 
 
 		 201 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  26.2 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  26.2 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  26.2 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  23.76 
 
 		 232 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  24.32 
 
 		 562 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  25.67 
 
 		 214 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  25.55 
 
 		 207 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  24.58 
 
 		 223 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  24.32 
 
 		 214 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>