18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3545 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  100 
 
 		 221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  83.48 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  84.24 
 
 		 370 aa  358  5e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  80.88 
 
 		 244 aa  341  4e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  74.42 
 
 		 406 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  74.42 
 
 		 406 aa  339  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  72.4 
 
 		 394 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  75.6 
 
 		 407 aa  337  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  71.36 
 
 		 343 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  70 
 
 		 344 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  71.92 
 
 		 353 aa  294  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  71.92 
 
 		 356 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  71.92 
 
 		 356 aa  293  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  70.05 
 
 		 274 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  64.25 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  55.38 
 
 		 198 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  24.32 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  22.78 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>