21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3044 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  100 
 
 		 370 aa  736    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  78.7 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  57.51 
 
 		 406 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  58.24 
 
 		 406 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  69.58 
 
 		 394 aa  345  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  77.34 
 
 		 407 aa  343  4e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  84.24 
 
 		 221 aa  339  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  78.64 
 
 		 244 aa  338  9e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  76.85 
 
 		 343 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  76.85 
 
 		 344 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  65.12 
 
 		 353 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  76.35 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  76.35 
 
 		 356 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  63.57 
 
 		 274 aa  287  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  64.53 
 
 		 230 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  56.02 
 
 		 198 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  25.91 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  48.19 
 
 		 926 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1261 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  49.41 
 
 		 630 aa  45.8  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  37.89 
 
 		 897 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>