23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0977 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0977  membrane protein  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0130473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  62.28 
 
 		 406 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  78 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  61.54 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  77 
 
 		 394 aa  319  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  80.31 
 
 		 343 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2811  membrane protein  67.54 
 
 		 244 aa  316  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  77 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  77 
 
 		 356 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  77 
 
 		 356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  75 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  63.18 
 
 		 370 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  78.19 
 
 		 344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  70.05 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1006  membrane protein  64 
 
 		 230 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1031  membrane protein  61.54 
 
 		 198 aa  242  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1108  hypothetical protein  26.39 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  28.09 
 
 		 179 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  26.97 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  24.16 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1110  hemK protein  36.36 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  25.37 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  23.78 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>