41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3587 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  84.02 
 
 
223 aa  354  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  80.29 
 
 
232 aa  348  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  80 
 
 
232 aa  342  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3623  hypothetical protein  70.43 
 
 
233 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3494  hypothetical protein  70.43 
 
 
233 aa  305  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0827  hypothetical protein  70 
 
 
233 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0665  hypothetical protein  71.49 
 
 
234 aa  287  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  62.5 
 
 
214 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  64.71 
 
 
214 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  64.71 
 
 
214 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  64.71 
 
 
214 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  64.71 
 
 
214 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  64.71 
 
 
214 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  64.22 
 
 
562 aa  265  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  64.22 
 
 
214 aa  265  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  63.73 
 
 
214 aa  262  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0686  aphA-like regulator  33.51 
 
 
232 aa  89  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000629381  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  24.44 
 
 
179 aa  59.3  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  26.67 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  25.6 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2818  membrane protein  24.58 
 
 
343 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3362  membrane protein  23.03 
 
 
353 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.019769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3224  membrane protein  23.03 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1144  membrane protein  23.03 
 
 
356 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3223  membrane protein  23.03 
 
 
344 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1045  membrane protein  25.26 
 
 
394 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000754815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1106  membrane protein  24.23 
 
 
406 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1222  hypothetical protein  24.23 
 
 
407 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
782 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1041  membrane protein  25.26 
 
 
406 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.66781  hitchhiker  0.000114763 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3044  membrane protein  23.33 
 
 
370 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0623  peripheral membrane protein  27.85 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.454122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3374  membrane protein  22.47 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3545  membrane protein  22.47 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00086416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>