28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0686 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0686  aphA-like regulator  100 
 
 
232 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000629381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  30.92 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  32.32 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  31.1 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  30.05 
 
 
223 aa  82  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  32.24 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  30.46 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  32.24 
 
 
562 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  30.46 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  30.46 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  30.46 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  30.46 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  29.61 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3623  hypothetical protein  28.87 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3494  hypothetical protein  28.87 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0665  hypothetical protein  30.73 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0827  hypothetical protein  28.35 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  28.47 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  29.32 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  29.2 
 
 
179 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0623  peripheral membrane protein  30.14 
 
 
199 aa  52.8  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.454122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>