31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3623 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3623  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3494  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0827  hypothetical protein  99.57 
 
 		 233 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  74.65 
 
 		 232 aa  332  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  70.43 
 
 		 226 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0548  hypothetical protein  74.4 
 
 		 232 aa  320  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  71.3 
 
 		 223 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0665  hypothetical protein  74.79 
 
 		 234 aa  304  8.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4935  hypothetical protein  66.5 
 
 		 214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4987  hypothetical protein  66.5 
 
 		 214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4828  hypothetical protein  66.5 
 
 		 214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4901  hypothetical protein  66.5 
 
 		 214 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4989  hypothetical protein  66.5 
 
 		 214 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  66.02 
 
 		 562 aa  270  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0546  hypothetical protein  63.85 
 
 		 214 aa  269  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0805986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04228  hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3611  conserved hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4936  hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.835415 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3669  hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.891572  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4986  hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4622  hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04263  hypothetical protein  66.02 
 
 		 214 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4934  hypothetical protein  65.53 
 
 		 214 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.921583  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0686  aphA-like regulator  29.19 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000629381  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1925  putative smp protein  26.32 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03373  hypothetical protein  23.78 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002633  Smp-like protein  23.08 
 
 		 179 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4702  hypothetical protein  27.89 
 
 		 488 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431298  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4963  hypothetical protein  27.89 
 
 		 472 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4786  hypothetical protein  27.89 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.434789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4910  hypothetical protein  27.89 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>