18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4786 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4958  HAMP domain protein  72.1 
 
 		 513 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0556  histidine kinase, HAMP region  74.26 
 
 		 513 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4702  hypothetical protein  89.78 
 
 		 488 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431298  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4963  hypothetical protein  95.13 
 
 		 472 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4786  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  974    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.434789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4910  hypothetical protein  98.97 
 
 		 485 aa  962    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0505  histidine kinase, HAMP region  72.98 
 
 		 504 aa  621  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0696237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0617  hypothetical protein  66.47 
 
 		 510 aa  549  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5690  hypothetical protein  65.82 
 
 		 513 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65570  hypothetical protein  65.35 
 
 		 512 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07400  HAMP domain protein  48.72 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1309  hypothetical protein  25.57 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.23 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  28.77 
 
 		 232 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1074  Acetyl-CoA carboxylase, alpha subunit  28.78 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.33 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  30.34 
 
 		 223 aa  45.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3587  hypothetical protein  28.44 
 
 		 226 aa  43.5  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>