17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0556 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4958  HAMP domain protein  95.32 
 
 		 513 aa  846    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4702  hypothetical protein  73.87 
 
 		 488 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431298  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4786  hypothetical protein  74.02 
 
 		 485 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.434789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0505  histidine kinase, HAMP region  78.39 
 
 		 504 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0696237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0556  histidine kinase, HAMP region  100 
 
 		 513 aa  1030    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4910  hypothetical protein  73.48 
 
 		 485 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4963  hypothetical protein  73.33 
 
 		 472 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5690  hypothetical protein  65.84 
 
 		 513 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0617  hypothetical protein  65.84 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65570  hypothetical protein  63.92 
 
 		 512 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07400  HAMP domain protein  49.45 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1309  hypothetical protein  23.11 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.65 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1074  Acetyl-CoA carboxylase, alpha subunit  31.25 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  23.39 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1901  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 686 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  31.03 
 
 		 223 aa  43.5  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>