17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4963 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4786  hypothetical protein  95.97 
 
 		 485 aa  796    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.434789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4910  hypothetical protein  95.55 
 
 		 485 aa  798    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4963  hypothetical protein  100 
 
 		 472 aa  943    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4702  hypothetical protein  88.61 
 
 		 488 aa  721    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431298  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4958  HAMP domain protein  71.77 
 
 		 513 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0556  histidine kinase, HAMP region  73.13 
 
 		 513 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0505  histidine kinase, HAMP region  73.23 
 
 		 504 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0696237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0617  hypothetical protein  65.53 
 
 		 510 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5690  hypothetical protein  64.59 
 
 		 513 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65570  hypothetical protein  63.91 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07400  HAMP domain protein  48.96 
 
 		 547 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1309  hypothetical protein  24.01 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.77 
 
 		 465 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1074  Acetyl-CoA carboxylase, alpha subunit  21.53 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0451  hypothetical protein  28.77 
 
 		 232 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0893535  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  31.33 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3468  hypothetical protein  30.34 
 
 		 223 aa  45.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>