16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4958 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4910  hypothetical protein  73.08 
 
 		 485 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4958  HAMP domain protein  100 
 
 		 513 aa  1034    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0556  histidine kinase, HAMP region  95.32 
 
 		 513 aa  865    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0505  histidine kinase, HAMP region  77.8 
 
 		 504 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0696237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4786  hypothetical protein  73.28 
 
 		 485 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.434789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4963  hypothetical protein  71.72 
 
 		 472 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0617  hypothetical protein  65.9 
 
 		 510 aa  557  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5690  hypothetical protein  64.56 
 
 		 513 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65570  hypothetical protein  64.37 
 
 		 512 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07400  HAMP domain protein  48.72 
 
 		 547 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.256184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4702  hypothetical protein  85.59 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.431298  normal  0.864658 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1309  hypothetical protein  23.27 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.65 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1074  Acetyl-CoA carboxylase, alpha subunit  31.25 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  23.39 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1901  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 686 aa  44.3  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>